مطالعه ویژگی های فنوتیپی، ژنوتیپی و دامنه میزبانی استرین های Pseudomonas savastanoi، عامل گال زیتون و خرزهره

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه حشره‎شناسی و بیماری‎های گیاهی، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران، ایران

2 دانشیار پژوهش، مؤسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

3 استادیار، گروه حشره‎شناسی و بیماری‎های گیاهی، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران

4 استادیار پژوهش، مؤسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

doi
10.22092/ijfrpr.2022.357448.1535
چکیده

به‌منظور مطالعه خصوصیات فنوتیپی، مولکولی، بیماری‌زایی و فیلوژنتیکی عوامل باکتریایی گال‌های زیتون و خرزهره، نمونه‌هایی از برگ، دمبرگ، شاخه و تنه این درختان که دارای علائم گره یا گال بودند، از شهرستان‎های مختلف استان‎های مازندران، گیلان، قزوین و تهران جمع‌آوری و به آزمایشگاه منتقل شد. از محیط‌کشت Kings’B برای جداسازی استفاده شد و ۱۸۰ جدایه با رنگدانه سبز فلورسانت خالص‎سازی شد. آزمون بیماری زایی استرین های جداشده از گال زیتون و گال خرزهره نشان داد که این استرین ها روی میزبان اصلی خود بیماری زا بودند. در آزمون‌های LOPAT، تولید لوان، آنزیم اکسیداز، آنزیم آرژنین‌دی‌هیدرولاز و پوسیدگی سیب‌زمینی، منفی و در آزمون فوق‌حساسیت در توتون و شمعدانی مثبت بودند. واکنش PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی عوامل گال زیتون (PsvF/PsvR) و خرزهره (PsnF/PsnR) انجام شد و به ترتیب در 18 جدایه از نمونه‌های گال خرزهره و 14 جدایه از نمونه‌های گال زیتون باند به اندازه ۳۸۸ و ۳۴۹ تکثیر شد. براساس ویژگی‌های فنوتیپی، بیماری‎زایی و استفاده از آغازگرهای اختصاصی جدایه‌های زیتون و خرزهره به‎ترتیب، Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi و P. savastanoi pv. nerii شناسایی شدند. به‌منظور تعیین دقیق جایگاه تاکسونومیکی جدایه‌ها از روش تجزیه و تحلیل توالی چند مکانی (MLSA) با تکثیر و توالی‌یابی قطعه‎ ای از سه ژن خانه‌دار rpoB، rpoD و gyrB استفاده شد. درخت‎های فیلوژنی مبتنی بر توالی ژن‎های gyrB و rpoB نتوانست استرین‎ های Psv و Psn را از هم تفکیک کند، درخت فیلوژنی رسم‎ شده بر اساس ژن rpoD استرین‎های Psv و Psn را از هم تفکیک کرد.