مطالعه ویژگی های فنوتیپی، ژنوتیپی و دامنه میزبانی استرین های Pseudomonas savastanoi، عامل گال زیتون و خرزهره
نویسندگان
1 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه حشرهشناسی و بیماریهای گیاهی، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران، ایران
2 دانشیار پژوهش، مؤسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
3 استادیار، گروه حشرهشناسی و بیماریهای گیاهی، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران
4 استادیار پژوهش، مؤسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
doi
10.22092/ijfrpr.2022.357448.1535چکیده
بهمنظور مطالعه خصوصیات فنوتیپی، مولکولی، بیماریزایی و فیلوژنتیکی عوامل باکتریایی گالهای زیتون و خرزهره، نمونههایی از برگ، دمبرگ، شاخه و تنه این درختان که دارای علائم گره یا گال بودند، از شهرستانهای مختلف استانهای مازندران، گیلان، قزوین و تهران جمعآوری و به آزمایشگاه منتقل شد. از محیطکشت Kings’B برای جداسازی استفاده شد و ۱۸۰ جدایه با رنگدانه سبز فلورسانت خالصسازی شد. آزمون بیماری زایی استرین های جداشده از گال زیتون و گال خرزهره نشان داد که این استرین ها روی میزبان اصلی خود بیماری زا بودند. در آزمونهای LOPAT، تولید لوان، آنزیم اکسیداز، آنزیم آرژنیندیهیدرولاز و پوسیدگی سیبزمینی، منفی و در آزمون فوقحساسیت در توتون و شمعدانی مثبت بودند. واکنش PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی عوامل گال زیتون (PsvF/PsvR) و خرزهره (PsnF/PsnR) انجام شد و به ترتیب در 18 جدایه از نمونههای گال خرزهره و 14 جدایه از نمونههای گال زیتون باند به اندازه ۳۸۸ و ۳۴۹ تکثیر شد. براساس ویژگیهای فنوتیپی، بیماریزایی و استفاده از آغازگرهای اختصاصی جدایههای زیتون و خرزهره بهترتیب، Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi و P. savastanoi pv. nerii شناسایی شدند. بهمنظور تعیین دقیق جایگاه تاکسونومیکی جدایهها از روش تجزیه و تحلیل توالی چند مکانی (MLSA) با تکثیر و توالییابی قطعه ای از سه ژن خانهدار rpoB، rpoD و gyrB استفاده شد. درختهای فیلوژنی مبتنی بر توالی ژنهای gyrB و rpoB نتوانست استرین های Psv و Psn را از هم تفکیک کند، درخت فیلوژنی رسم شده بر اساس ژن rpoD استرینهای Psv و Psn را از هم تفکیک کرد.