ردیابی و آنالیز تبارزایی چهار ویروئید مهم آلوده کننده ‌تاکستان های استان زنجان

نویسندگان

1 گروه گیاهپزشکی، بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان. زنجان. ایران.

2 گروه گیاهپزشکی، بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان. زنجان. ایران.

3 گروه گیاهپزشکی، بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان. زنجان. ایران.

4 گروه گیاهپزشکی، بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان. سنندج. ایران.

doi
10.22034/arpp.2021.13502
چکیده

چکیده  ویروئیدها در دو خانواده آوسان‌ ویروئیده با سه جنسPelamoviroid) ،  Avsunviroidو (Elaviroid و پوسپی‌ ویروئیده با پنج جنس (Pospiviroid, Coleviroid, Cocaviroid, Hostuviroid, Apscaviroid) طبقه­ بندی می‌شوند که ویروئیدهای شناخته شده انگور متعلق به سه جنس خانواده پوسپی‌ و‌یروئیده هستند. به­ منظور بررسی وضعیت آلودگی به ویروئیدهای انگور از تاکستان­ های استان زنجان نمونه‌برداری به‌صورت انتخابی از گیاهان دارای علائم مشکوک و همچنین فاقد علائم ظاهری مشخص بیماری‌های ویروئیدی انجام و در مجموع 121 نمونه گیاهی دارای علائم یا بدون علائم جمع‌آوری شد. استخراج آران­ای‌کل از بافت­های برگی و آوندی صورت‌ گرفت و سپس، ساخت دی­ان­ای مکمل (cDNA) با استفاده از آغازگر تصادفی شش تایی انجام شد. آزمون نسخه برداری معکوس-واکنش زنجیره ای پلیمراز (پی سی­آر) با استفاده از آغازگر اختصاصی ویروئیدهای برای ردیابی ویروئیدهای Grapevine yellow speckle viroid 1(GYSVd-1) ،(GYSVd-2)   Grapevine yellow speckle viroid 2،(HSVd)  Hop stunt viroid، Australian grapevine viroid (ASGVd) انجام شد و نتایج حاکی از تکثیر قطعات اختصاصی مربوط به ویروئیدهای ذکر شده به ترتیب در 16، 19، 24 و 26 نمونه (حدود 14%، 16%، 20% و 22% نسبت به کل نمونه ­های آزموده شده) بود. تعیین ترادف نوکلئوتیدی هفت محصول پی­سی­آر به صورت انتخابی وبررسی روابط تبارزائی بر اساس توالی­ های نوکلئوتیدی نشان‌ داد که جدایه ­های جدید ردیابی ­شده در این تحقیق با جدایه ­هایی که قبلاً از ایران گزارش شده­ اند در یک گروه تبار­زایی قرار می­گیرند. علاوه براین، آلودگی مخلوط ویروئیدهای مذکور نشان داد بیشترین آلودگی مخلوط مربوط به آلودگی با ویروئید کوتولگی رازک با سایر ویروئیدها در اکثر مناطق نمونه برداری شده بود. این مطالعه اولین گزارش از شناسایی ویروئیدهای مهم آلوده‌ کنندة تاکستان‌های استان زنجان بر اساس داده‌های مولکولی می باشد.