ردیابی و شناسایی Candidatus phytoplasma trifolii از درختان سیب در ایران

نویسندگان

1 گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

2 گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل.

3 گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

4 2بخش تحقیقات گیاه پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان خراسان رضوی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران.

5 گروه گیاهپزشکی، داﻧﺸﮕﺎه ﻋﻠﻮم ﻛﺸﺎورزی و ﻣﻨﺎﺑﻊ ﻃﺒﻴﻌﻲ ﮔﺮﮔﺎن.

6 کارشناس بخش مدیریت آب و خاک، سازمان جهاد کشاورزی استان خراسان رضوی- مشهد

doi
10.22034/arpp.2021.13306
چکیده

چکیده در بازدیدهای بهار و تابستان سال 1397 از باغات درختان سیب در استان خراسان رضوی، علائم مشکوک به بیماری فیتوپلاسمایی مانند زردی، ریزبرگی، و همچنین برگ­ هایی که گوشوارک در آن به طور غیرعادی کشیده شده بود در سطح باغات مشاهده شد و 33 نمونه از برگ درختان جمع­ آوری گردید. با استفاده از آغازگرهای عمومی P1 / P7 و آغازگرهای آشیان ه­ای R16F2n / R16R2، fU5 / rU3 و R16MF2 / R16MR2 در واکنش زنجیره­ای پلیمراز (PCR) از کلیه نمونه­های دارای علائم، قطعات 1800 جفت باز در PCR عمومی و در PCRهای آشیان ه­ای به ترتیب قطعات 1250، 876 و 1400 جفت باز تکثیر شدند. در نتایج حاصله مشخص گردید 18 نمونه آلوده به فیتوپلاسما مثبت بودند. محصول PCR دومرحله­ای با جفت آغازگرهای R16F2n / R16R2، همسانه­سازی و تعیین ترادف شده و در بانک جهانی ژن ثبت گردید. مقایسه توالی­ های به دست آمده با توالی ­های موجود در NCBI توسط نرم افزار BLAST و همچنین بررسی چند شکلی طولی قطعات برشی (RFLP) حقیقی با محصول PCR دومرحله­ ای با استفاده از آنزیم ­های AluI،  RsaIو Tru1I (MseI)، نشان داد که فیتوپلاسمای همراه درختان سیب بیشترین شباهت را با Candidatus Phytoplasma trifolii مربوط به گروه افژولش شبدر (Clover proliferation group, 16SrVI) دارند. آنالیز توالی­ ها با استفاده از نرم افزار iPhyClassifier، تعیین میزان تشابه نوکلئوتیدی و آنالیز تبارزایی با استفاده از ترادف کامل ژن RNA ریبوزومی 16S نیز تعلق فیتوپلاسمای همراه درختان سیب در استان خراسان رضوی را در گروه 16SrVI-A تایید کرد. این اولین گزارش از سیب­ های آلوده به Ca. Phytoplasma trifolii در ایران و سایر نقاط جهان است.