استفاده از روش های سری زمانی جهت پیش بینی بیان ژن های دفاعی گندم تلقیح شده با Zymoseptoria tritici و اسیدسالیسیلیک

نویسندگان

1 استادیار پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران.

2 استادیاردانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران.

3 استادیار دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران.

doi
چکیده

چکیده اندازه­گیری میزان بیان ژن­های دفاعی گیاهی روشی پرکاربرد و مفید برای بررسی مکانیسم مقاومت در گیاهان است، اما این روش در عین حال هزینه بر و زمان­بر نیز می­باشد. به منظور بررسی تأثیر اسیدسالیسیلیک بر تغییرات بیان بعضی از ژن­های دفاعی درگیر در مقاومت (NADPH اکسیداز، اگزالات اکسیداز، پروتئین Stress responsive، گلوتاتیون S ترانسفراز و سوپراکسید دیسموتاز) گندم­های تلقیح شده با بیمارگر  Z. triticiبه روش نوردرن­بلات معکوس بررسی شد. بر اساس اطلاعات به دست آمده از نوردرن بلات معکوس جهت پیش­بینی بیان ژن­های درگیر در مقاومت از روش­های میانگین متحرک ساده، میانگین متحرک وزنی و هموار سازی نمایی استفاده شد. در  24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر در همۀ ژن­های مورد بررسی و در هر دو تیمار میزان بیان به بیشترین مقدار خود رسید و علی­رغم تفاوت در هر ژن روند کلی افزایشی بود. نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از روش هموارسازی نمایی، با توجه به محاسبۀ و مقایسۀ شاخص‏های قدرت پیش­بینی، دارای دقت بالاتری نسبت به دو روش دیگر می­باشد. میزان بیان، در مورد سه ژن NADPH اکسیداز، گلوتاتیون S ترانسفراز و اگزالات اکسیداز روند مشابه داشتند، به عبارتی تا 24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر، اسیدسالیسیلیک باعث افزایش شد و سپس میزان بیان روند کاهشی در پیش گرفت. بررسی بیان ژن روش بسیار حساسی است، و باید تحت شرایط کنترل شده باشد، و فقط تیمار مورد نظر محقق، تأثیرگذار بر روی بیان ژن در گیاه باشد، در این شرایط، پیشنهاد می­شود اطلاعات بیان ژن­ها در طی دوره­هایی ابتدایی اندازه­گیری شود، سپس با استفاده از این اطلاعات و روش­های پیش‏بینی میزان بیان، برای زمان­های بعدی مورد پیش­بینی قرار گیرد.