استفاده از روش های سری زمانی جهت پیش بینی بیان ژن های دفاعی گندم تلقیح شده با Zymoseptoria tritici و اسیدسالیسیلیک
نویسندگان
1 استادیار پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران.
2 استادیاردانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران.
3 استادیار دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران.
doi
چکیده
چکیده اندازهگیری میزان بیان ژنهای دفاعی گیاهی روشی پرکاربرد و مفید برای بررسی مکانیسم مقاومت در گیاهان است، اما این روش در عین حال هزینه بر و زمانبر نیز میباشد. به منظور بررسی تأثیر اسیدسالیسیلیک بر تغییرات بیان بعضی از ژنهای دفاعی درگیر در مقاومت (NADPH اکسیداز، اگزالات اکسیداز، پروتئین Stress responsive، گلوتاتیون S ترانسفراز و سوپراکسید دیسموتاز) گندمهای تلقیح شده با بیمارگر Z. triticiبه روش نوردرنبلات معکوس بررسی شد. بر اساس اطلاعات به دست آمده از نوردرن بلات معکوس جهت پیشبینی بیان ژنهای درگیر در مقاومت از روشهای میانگین متحرک ساده، میانگین متحرک وزنی و هموار سازی نمایی استفاده شد. در 24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر در همۀ ژنهای مورد بررسی و در هر دو تیمار میزان بیان به بیشترین مقدار خود رسید و علیرغم تفاوت در هر ژن روند کلی افزایشی بود. نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از روش هموارسازی نمایی، با توجه به محاسبۀ و مقایسۀ شاخصهای قدرت پیشبینی، دارای دقت بالاتری نسبت به دو روش دیگر میباشد. میزان بیان، در مورد سه ژن NADPH اکسیداز، گلوتاتیون S ترانسفراز و اگزالات اکسیداز روند مشابه داشتند، به عبارتی تا 24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر، اسیدسالیسیلیک باعث افزایش شد و سپس میزان بیان روند کاهشی در پیش گرفت. بررسی بیان ژن روش بسیار حساسی است، و باید تحت شرایط کنترل شده باشد، و فقط تیمار مورد نظر محقق، تأثیرگذار بر روی بیان ژن در گیاه باشد، در این شرایط، پیشنهاد میشود اطلاعات بیان ژنها در طی دورههایی ابتدایی اندازهگیری شود، سپس با استفاده از این اطلاعات و روشهای پیشبینی میزان بیان، برای زمانهای بعدی مورد پیشبینی قرار گیرد.