چندشکلی و بیان دو پروتئین LysM-RLK در سیب زمینی قبل و بعد از بروز بیماری بلایت زودرس
نویسندگان
1 استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد.
2 استاد، دانشکده علوم گیاهی، دانشگاه مک گیل، سنت ان د بلوو، کانادا.
doi
چکیده
چکیده گیرندههای (LysM-RLKs) Lysin Motif Receptor-like Kinases، به دلیل وجود موتیف لیزین ((LysM، به کیتین آزاد شده از دیوارهی قارچها متصل و سبب فعال شدن آبشاری از پروتئینها و در نهایت سبب افزایش مقاومت به پاتوژنها میشوند. برای بررسی بیان LysM-RLKs احتمالی ژنوم سیب زمینی در یک رقم حساس (Russet Burbank) و یک ژنوتیپ نسبتاً مقاوم (F06037) به Alternaria solani، میزان بیان و توالی LysM آنها به روشهای بیوانفورماتیکی و مولکولی مطالعه شد. در مجموع 35 پروتئین LysM-RLKs در ژنوم سیب زمینی شناسایی شد که از این تعداد، 26 پروتئین بدون LysM و تعداد پنج وچهار پروتئین به ترتیب دارای یک یا دو LysM بودند. از نه گیرنده LysM-RLKs ، تعداد دو گیرنده LysM-RLKs در اثر آلودگی به A. solani افزایش بیان نشان دادند. پروتئین PGSC0003DMP400061331 با دو LysM بیان بیشتری در مقایسه با پروتئین PGSC0003DMP400060418 با یک LysM داشت. این پروتئینها به ترتیب با پروتئین CERK1 آرابیدوپسیس (AB367524) 98 و 81 درصد شباهت داشتند. همردیفی ناحیهی LysM این دو پروتئین با یکدیگر و با ناحیهی همولوگ در پروتئین CERK1 آرابیدوپسیس نشان داد که دو LysM پروتئین PGSC0003DMP400061331 در دو رقم تفاوتی نداشتند، اما در LysM اول پروتئین PGSC0003DMP400061331 یک ناحیه به توالی "NRD" وجود دارد که در LysM دوم همین پروتئین و پروتئین CERK1 آرابیدوپسیس دیده نمیشود و به نظر میرسد که حاصل حذف یا اضافه شدگی باشد. با انجام روشهای ویرایش ژنوم میتوان نقش این ژنها را در موضوع مقاومت یا حساسیت به قارچ A. solaniمشخص نمود و از نتایج حاصل برای تولید گیاهان تراریخت مقاوم استفاده کرد.