تعیین ویژگی های فنوتیپی و گروه بندی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر زردآلو در استان آذربایجان شرقی با تکیه بر فعالیت هسته‏ ی یخ

نویسندگان

1 استادیار پژوهشی بخش تحقیقات گیاه پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان هرمزگان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، بندرعباس، ایران.

2 دانشیار گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه تبریز، ایران.

3 دانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، ایران

4 دانشیار گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، ایران.

5 استاد گروه علوم بیماری شناسی گیاهی، فیزیولوژی و علفهای هرز، دانشکده علوم گیاهی و محیط زیست، دانشگاه ویرجینیاتک، آمریکا.

doi
چکیده

چکیده شانکر باکتریایی درختان میوه­ی هسته­دار یکی از مهم­­ترین بیماری­های هسته­داران در جهان می­باشد. در سال‏های اخیر گسترش علایم شانکر همراه با ترشح صمغ و بلاست شکوفه در مناطقی از استان آذربایجان­شرقی مشاهده گردیده است. از بافت­های آلوده­ی جوانه، شکوفه، شاخه و تنه­ی درختان باغات زردآلو بر اساس آزمون­های ریخت‏شناسی، فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی گروه LOPAT و GATTa، جدایه­های فلورسنت Pseudomonas yringae pv. syringae (Pss) جداسازی و شناسایی شدند. جدایه­ها ترجیح میزبانی نداشته و با درجات مختلف پرآزاری روی سرشاخه­های سبز بریده‏ی زردآلو و غلاف­های لوبیاسبز بیماری­زایی نشان دادند. در تمامی جدایه­ها قطعه 725 جفت­بازی ژن syrB دخیل در سنتز زهرابه سیرینگومایسین ردیابی گردید و جدایه­ها با اختلاف معنی­داری از رشد رویشی پرگنه‏ی قارچ Geotrichum candidum با تولید زهرابه ممانعت کردند. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی­شده INAF/INAR بخشی از ناحیه­ی ژنی inaZ تکثیر شد و فنوتیپ فعالیت هسته‏ی یخ با درجات مختلف در کلیه‏ی جدایه­ها مشاهده گردید. با تعیین توالی بخشی از ناحیه 16S rRNA و ژن­های rpoD و inaZ تنوع ژنتیکی در میان جدایه­ها با رسم تبارنما بر اساس روش بایزین مشاهده شد. نتایج این پژوهش نشان داد که در میان جدایه­های Pss عامل شانکر زردآلو هم از لحاظ فنوتیپ بیماری­زایی، سنتز زهرابه و تشکیل هسته‏ی یخ و هم از لحاظ ژنتیکی تنوع وجود دارد.