تشخیص مولکولی گونه ی Biscogniauxia mediterranea، عامل بیماری ذغالی بلوط، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی
نویسندگان
1 دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
2 دانشجوی دکتری، رشته حشره شناسی کشاورزی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
3 استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
4 استاد، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
5 دانشجوی دکتری، رشته بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
doi
چکیده
چکیده گونهی Biscogniauxia mediterranea، عامل بیماری ذغالی بلوط، به عنوان یکی از عوامل اصلی دخیل در زوال بلوط در ایران معرفی شده است. با این حال اطلاعاتی در مورد پراکنش، دامنهی میزبانی، روشهای انتشار و انتقال عامل بیماری در مناطق آلوده و همچنین احتمال شیوع بیماری در سایر مناطق جنگلی ایران در دسترس نمیباشد. تحقیق حاضربا هدف توسعهی یک روش مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیرهای پلیمرازی جهت تشخیص گونهی B. mediterranea براساس آغازگرهای اختصاصی گونه، اجرا گردید. بدین منظور نمونهبرداری از درختان بلوط با علایم بیماری ذغالی در استان ایلام صورت گرفت. عامل بیماری با استفاده از تکنیکهای متعارف در بیماریشناسی گیاهی جداسازی و خالص سازی گردید. جدایههای Biscogniauxia براساس ویژگیهای ریختشناختی مرحلهی جنسی و توالی یابی ناحیه ITS-rDNAگونهی B. mediterranea شناسایی گردیدند. دادههای توالی ناحیهی ITS-rDNA برای کلیهی گونههای Biscogniauxia موجود در بانک ژن دریافت و همراه با توالیهای ایجاد شده در این تحقیق زیر هم چینی و یک جفت آغازگر اختصاصی (BmF/BmR) با طول قطعهی مورد انتظار400 جفت باز، برای تشخیص مولکولی B. mediterranea طراحی گردید. کارایی جفت آغازگر طراحی شده با استفاده از DNA جدایههای B. mediterranea و دیگر گروههای قارچی جداسازی شده از بافتهای درختان بلوط طی واکنش زنجیرهای پلیمرازی ارزیابی گردید. نتایج حاصل از بررسی محصول واکنش روی ژل آگارز نشان داد که قطعه 400 جفت بازی فقط از جدایههای گونهی B. mediterranea تکثیر میشود. آغازگرهای اختصاصی طراحی شده در این تحقیق در برنامههای مربوط به ردیابی عامل بیماری، مطالعهی پراکنش، دامنهی میزبانی و روشهای انتشار عامل بیماری قابل استفاده خواهند بود.