تشخیص مولکولی گونه ی Biscogniauxia mediterranea، عامل بیماری ذغالی بلوط، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی

نویسندگان

1 دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.

2 دانشجوی دکتری، رشته حشره شناسی کشاورزی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.

3 استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.

4 استاد، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.

5 دانشجوی دکتری، رشته بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.

doi
چکیده

چکیده گونه­ی Biscogniauxia mediterranea، عامل بیماری ذغالی بلوط، به عنوان یکی از عوامل اصلی  دخیل در زوال بلوط در ایران معرفی شده است. با این حال اطلاعاتی در مورد پراکنش، دامنه­ی میزبانی، روش­های انتشار و انتقال عامل بیماری در مناطق آلوده و همچنین احتمال شیوع بیماری در سایر مناطق جنگلی ایران در دسترس نمی­باشد. تحقیق حاضربا هدف توسعه­ی یک روش مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیره­ای پلی­مرازی جهت تشخیص گونه­ی                    B. mediterranea براساس آغازگرهای اختصاصی گونه، اجرا گردید. بدین منظور نمونه­برداری از درختان بلوط با علایم بیماری ذغالی در استان ایلام صورت گرفت. عامل بیماری با استفاده از تکنیک­های متعارف در بیماری­شناسی گیاهی جداسازی و خالص سازی گردید. جدایه­های Biscogniauxia  براساس ویژگی­های ریخت­شناختی مرحله­ی جنسی و توالی یابی ناحیه ITS-rDNAگونه­ی B. mediterranea شناسایی گردیدند. داده­های توالی ناحیه­ی ITS-rDNA برای کلیه­ی گونه­های Biscogniauxia  موجود در بانک ژن دریافت و همراه با توالی­های ایجاد شده در این تحقیق زیر هم چینی و یک جفت آغازگر اختصاصی (BmF/BmR) با طول قطعه­ی مورد انتظار400 جفت باز، برای تشخیص مولکولی B. mediterranea  طراحی گردید. کارایی جفت آغازگر طراحی شده با استفاده از DNA جدایه­های  B. mediterranea و دیگر گروه­های قارچی جداسازی شده از بافت­های درختان بلوط طی واکنش زنجیره­ای پلی­مرازی ارزیابی گردید. نتایج حاصل از بررسی محصول واکنش روی ژل آگارز نشان داد که قطعه 400 جفت بازی فقط از جدایه­های گونه­ی B. mediterranea تکثیر می‌شود. آغازگرهای اختصاصی طراحی شده در این تحقیق در برنامه­های مربوط به ردیابی عامل بیماری، مطالعه­ی پراکنش، دامنه­ی ­میزبانی و روش­های انتشار عامل بیماری قابل استفاده خواهند بود.