شناسایی مولکولی و تجزیه¬تحلیل تبارزایی ویروس موزاییک خیار زیرگروه IB جداشده از گیاه دارویی ختمی
نویسندگان
1 دانشجوی دوره دکتری بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه تبریز
2 دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشگاه تبریز.
3 استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه آزاداسلامی واحدتبریز
doi
چکیده
ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus (CMV) ، از جنس Cucumovirus و خانواده Bromoviridae میباشد. خَتمی (Althaea officinalis) گیاهی یکساله و خودرو از تیره پنیرکیان است که گل، میوه و ریشه آن مصارف دارویی دارد. در این تحقیق، پنج نمونه مشکوک به آلودگی با CMV از گیاه ختمی جمعآوری و وجود CMV با آزمونهای سرولوژیکی از جمله DAS-ELISA ، از نمونهها ردیابی شد. از بین آنها، جدایه Ta-alth انتخاب و پس از استخراج RNA کل از گیاه آلوده به آن، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه ژن پروتئین پوششی، RT-PCR انجام و قطعه 675 جفت بازی تکثیر شد. قطعه تکثیر شده درون پلاسمید pTZ57R/T همسانهسازی و سپس تبدیل سلولهای مستعد Escherichia coli سویه DH5α انجام گردید. جهت حصول اطمینان از قرارگرفتن قطعه موردنظر درون حامل، تجزیهتحلیل پلاسمید نوترکیب خالصسازیشده با استفاده از آنزیمهای برشی انجام و توالی قطعه تکثیری تعیین گردید. توالی بهدستآمده با استفاده از برنامه GeneDoc با توالیهای متناظر سایر جدایههای CMV از ایران و نقاط دیگر دنیا (موجود در بانک ژن) مقایسه و درخت تبارزایی با استفاده از روش Neighbor-Joining(NJ) و برنامه TREECON رسم گردید. تجزیهتحلیل ترادف ژن پروتئین پوششی جدایهTa-alth نشان داد که این جدایه متعلق به زیرگروه IB ویروس موزاییک خیار میباشد. این اولین گزارش از آلودگی ختمی به CMV در ایران است.