بررسی بیوانفورماتیکی برای تعیین بیومارکرهای کلیدی در سرطان پروستات

نویسندگان

1 پژوهشکده تجهیزات و فناوری های انتظامی، پژوهشگاه علوم انتظامی و مطالعات اجتماعی فراجا، تهران، ایران

2 مرکز تحقیقات علوم و فناوری‌های زیستی و سلامت پلیس، معاونت بهداشت، امداد و درمان، فرماندهی انتظامی، تهران، ایران

doi
10.22034/pjms.2024.710080
چکیده

مقدمه: درمان موثر در سرطان پروستات اهمیت ویژه ای دارد. حفظ کیفیت زندگی افراد مبتلا به این نوع رایج سرطان حیاتی است. یافتن روش های درمانی جدید مبتنی بر علوم مدرن همچون بیوانفورماتیک برای امکان داشتن برنامه های پزشکی شخصی متناسب با نیازهای فرد ضروری است. امکان برنامه‌های پزشکی شخصی متناسب با نیازهای فرد را فراهم می‌کند. علاوه بر این،  پیشرفت های مذکور می توانند به توسعه اقدامات پیشگیرانه در راستای کاهش میزان خطر ابتلا به این نوع سرطان کمک کنند.روش کار: مجموعه داده‌های بیان ژن GSE55945 از NCBI-GEO بارگذاری و ژن‌های دارای تفاوت بیان (DEG) تجزیه و تحلیل شدند. نقش ژن ها در فرآیندهای بیولوژیکی و مسیرهای غنی‌سازی آن ها در پایگاه Enrichr توسط دانشنامه ژن و ژنوم کیوتو (KEGG)  Reactome، Bioplanet و غیره نمایش داده شد. همچنین شبکه‌های پروتئین-پروتئین (PPI) ترسیم شد.نتایج: در مجموع هفت ژن کلیدی شامل CCK، NOX4، CALM1، CACNA1D، MYLK، CAV1 و AOX1 شناسایی شد. تحلیل های مربوط به فرآیندهای مولکولی نشان داد که بیشتر ژن‌های دارای تفاوت بیان در سازوکار متابولیسم دارو نقش دارند. همچنین، نتایج نشان داد که عملکرد مولکولی اکثر ژن‌ها مربوط به فرآیندهای وابسته به G-protein  و متابولیسم اینوزیتول فسفات است. نتیجه گیری: ژن های دارای تفاوت بیان، ژن های کلیدی و مسیرهای سیگنالی شناسایی شده در این مطالعه ممکن است به درک سازوکارهای مولکولی سرطان پروستات کمک کرده و اهداف احتمالی برای تشخیص و درمان این بیماری ارائه دهند.