فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

مقدمه :ایمونوگلوبولین ها [immunoglobulins (Igs)] پاتوژن ها را به طور اختصاصی شناسایی و منهدم می کنند. ایمونوگلوبولینG  (IgG) فراوانترین Ig سرم بوده و نقش مهمی در دفاع علیه عوامل عفونی دارد. بخش دارای قابلیت کریستالیزاسیون [ fragment of crystallizable (Fc) ] مولکولIgG، نقش اساسی در حذف عوامل بیگانه بازی می کند. بررسی خصوصیات فیزیکوشیمیایی Fc مولکول IgG، در شناسایی بهتر اعمال آن و اهداف تشخیصی و درمانی سود مند است. بیوانفورماتیک حوزه علمی کارامدی است که از حجم عظیم اطلاعات زیستی موجود در کامپیوتر برای حل مسائل زیستی استفاده می کند. هدف این پژوهش شناسایی ویژگی های فیزیکوشیمیایی ناحیه Fc مولکول IgG انسان با استفاده از بیوانفورماتیک بود.روش کار: توالی و ساختار سوم IgG مرجع انسان در پایگاه داده PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم آن با نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2) و ویژگی های فیزیکوشیمیایی شامل انعطاف پذیری، دسترسی سطحی و آب دوستی بخش Fc مولکول IgG توسط مرورگر IEDB (Immune Epitope Database) تعیین شدند. یافته ها: در بخش Fc مولکول IgG انسان، مناطق دارای بیشترین دسترسی سطحی، آب دوستی و انعطاف پذیری در توالی حد فاصل اسید آمینه های شماره 200-450 واقع شده اند. به علاوه، نواحی مذکور در توالی بین اسید های آمینه شماره 291-300 و 381-400 هم پوشانی دارند که محتمل ترین مناطق قرارگیری اپی توپ ها هستند.نتیجه گیری: ویژگی های فیزیکوشیمیایی ناحیه Fc مولکول IgG انسان که در این مطالعه تعیین شدند، در شناسایی هرچه بهتر اعمال IgG و پیشگویی اپی توپ های ایمونوژن آن برای تولید آنتی بادی های منوکلونال اختصاصی و در نهایت تولید کیت های تشخیصی، بهینه سازی کیت های موجود و تولید پروتئین های مشابه برای تشخیص، درمان و همچنین مطالعات فیلوژنتیکی سود مند هستند.