شناسایی سرولوژیکی و مولکولی ویروس زردی شلغم در مزارع کلزای استان کرمانشاه

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

2 عضو هیأت علمی دانشگاه رازی

3 گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

doi
10.22059/ijpps.2020.311331.1006954
چکیده

اعضای جنس پولروویروس ازجمله ویروس زردی شلغم (Turnip yellows virus, TuYV) از ویروس‌های مهم در گیاهان زراعی هستند. این ویروس‌ها توسط شته‌ها به‌صورت گردشی- غیرتکثیری انتقال پیدا می‌کنند. طی سال‌های ۱۳۹۷ و ۱۳۹۸ تعداد 32 نمونه‌ی برگ کلزا و یک نمونه خردل وحشی از مزارع استان کرمانشاه جمع‌آوری شد. این نمونه‌ها با کیت تاس-الیزا DSMZ که چهار گونۀ پولروویروس شامل TuYV، Beet mild yellowing virus (BMYV)، Beet western yellows virus (BWYV) و Beet chlorosis virus (BChV) را شناسایی می‌کند، آزمایش شدند. در آزمون تاس-الیزا، هفت نمونه کلزا و نمونه خردل وحشی پاسخ مثبت نشان دادند. برای آزمون انتقال ویروس از Myzus persicae و ‌Brevicoryne brassicae استفاده شد که در گیاهان کلزا و تربچه موفقیت‌آمیز بود ولی آلودگی به چغندرقند منتقل نگردید. در IC-RT-PCR با آغازگرهای اختصاصی، یک قطعه با اندازه ۷۸۰ جفت‌باز از ژن کد کننده P0 از نمونه خردل وحشی و دو نمونه کلزا تکثیر گردید. توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های کلزا و خردل وحشی بسیار مشابه بودند (۹۹٫۴ درصد همسانی) و در جستجوی BLAST با توالی‌های نوکلئوتیدی جدایه‌های TuYV، که بسیاری از آن‌ها از استرالیا و از گیاهان مختلف مانند شنبلیله، کلزا، نخودفرنگی و نخود بودند، تا ۹۷٫۲ درصد شباهت داشتند. در تحلیل فیلوژنتیک توالی‌های نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0، این دو جدایه به همراه سایر جدایه‌های TuYV در یک گروه قرار گرفته و از سایر پولروویروس‌ها مانند BMYV، BWYV و BChV متمایز بودند. در این پژوهش، شناسایی ویروس زردی شلغم در مزارع کلزای ایران بر اساس تعیین توالی نوکلئوتیدی ناحیه کدکننده P0 برای اولین بار در شهرستان کرمانشاه انجام گرفت.