جمعآوری و تعیین ویژگی جدایههای ایرانی ویروس چندوجهی هستهای کرم غوزه پنبه Helicoverpa armigera Single Nucleopolyhedro virus (HearSNPV) بر مبنای ژن پلیهدرین (polh)
نویسندگان
1 عضو هیات علمی دانشگاه تهران
2 دانشگاه شهید مدنی آذربایجان
3 بخش تحقیقات آنفلونزا و سایر بیماریهای تنفسی انستیتو پاستور ایران، تهران
4 گروه گیاهپزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج.
5 استادیار پژوهش، موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
6 عضو هیات علمی
doi
10.22059/ijpps.2020.302425.1006943چکیده
استفاده از روشهای مبتنی بر اسیدنوکلئیک در شناسایی ویروسها به دلیل ساختار کوچک ژنومی آنها و تفاوتهای جزئی در سطح نوکلئوتید بین جدایهها یا استرینها، از اهمیت زیادی برخوردار است. در پژوهش حاضر، لاروهای مرده و/یا بیمار از مزارع گوجهفرنگی مناطق مختلف جغرافیایی ایران جمعآوری و برای آلودگی باکولوویروسیHelicoverpa armigera Single nucleopolyhedrovirus (HearSNPV) با روش بهینهسازی شده بر اساس سدیم دودسیل سولفات برای استخراج OBs، بررسی شدند. واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی (Polh-a, Polh-b) طراحی شده بر اساس ناحیه حفاظت شده ژن پلیهدرین(Polh) برای 26 جدایه ثبت شده از ویروس Hear/H. zea-SNPV انجام یافت. آلودگی به HearSNPVبا تکثیر باندهای مونومورفیک 370 و 790 نوکلئوتیدی در 28 لارو تایید شد. همسانهسازی و تعیین توالی نوکلئوتیدی باندهای تکثیر شده، تعلق آنها به ژن Polhویروس چندوجهیهستهای گونههایarmigera H. و H. zea با شباهت بیش از 6/99 درصد را نشان داد. تجزیه و تحلیل تبارزایی جدایههای ایرانی HearSNPV همراه با سایر جدایههای ثبت شده از این ویروس در دنیا، جدایههای ایرانی را در گروه II آلفاباکولوویروسها طبقهبندی و کارایی بیشتر روش توسعه داده شده را اثبات کرد. پژوهش حاضر اولین گزارش از معرفی و شناسایی مولکولی جدایههای ایرانی HearSNPV با به کارگیری تکنینک PCR و DNA ویروس از لاروهای با هویت نامشخص بیمارگر، میباشد. با توجه به حصول اطمینان از موثر و مفید بودن این روش در غربالگری سریع لاروهای حشرات از نظر آلودگی به این ویروس و بررسی تبارزایش، بهرهمندی از آن در پژوهشهای آتی توصیه میگردد.
