آنالیز مولکولی جدایه‌های قارچ Fusarium culmorum عامل بیماری پوسیدگی طوقه و ریشۀ گندم با استفاده از نشانگر SSR

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ایلام، ایران

2 دانشیار بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ایلام، ایران

doi
10.22059/ijpps.2018.248877.1006821
چکیده

بیماری پوسیدگی طوقه و ریشۀ گندم برآمده از Fusarium culmorum یکی از مهم‌ترین بیماری‌های گندم در استان ایلام است. برای تعیین گوناگونی ژنتیکی بیمارگر در مزرعه‏های گندم استان ایلام، شمار 66 نمونۀ آلوده از مزرعه‏های شهرستان‌های گوناگون استان جمع‌آوری شد. پس از کشت، خالص‌سازی و شناسایی جدایه‌ها، آزمون مولکولی با به‌کارگیری پنج جفت آغازگر ریز ماهواره انجام شد. از آغازگرهای ریز ماهواره 25 آلل در جدایه‌ها تکثیر شد. میانگین تعداد آلل در هر جایگاه 2/5 مشاهده شد. شناسۀ چندشکلی نشانگرها در آغازگر F3 با 409/0 بیشترین و در آغازگر F11 با 179/0 کمترین مقدار را دارا بود. بر پایۀ خوشه‌بندی جدایه‏ها و با به‌کارگیری الگوریتم پیوست مجاور و نرخ همانندی جاکارد، در سطح همانندی 50 درصد جدایه‏ها در 18 گروه جدا از هم قرار گرفتند. نتیجه‏های تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 78 درصد از تنوع ژنتیکی در میان همۀ جدایه‌ها و تنها 22 درصد آن به منطقه‏های گوناگون جغرافیایی اختصاص دارد؛ بنابراین میان جدایه‌ها از منطقه‏های گوناگون همانندی ژنتیکی فراوانی وجود دارد. همانندی ژنتیکی بالا را می‌توان به مهاجرت ژن یا ژن‏مانه (ژنوتیپ) در اثر عامل‏های گوناگون نسبت داد.