بررسی ویژگیهای مولکولی یک جدایۀ ویروس وای سیبزمینی جداشده از محصول گوجهفرنگی از شهرستان یزد بر پایۀ توالی قسمتهایی از ژنوم
نویسندگان
1 استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ولیعصر (عج) رفسنجان
2 استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ولیعصر (عج) رفسنجان
3 مربی پژوهشی بخش تحقیقات گیاه پزشکی مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان یزد، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، یزد، ایران
4 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه ولیعصر (عج) رفسنجان
doi
10.22059/ijpps.2017.140753.1006685چکیده
گوجهفرنگی (Lycopersicum esculentum Mill.) یکی از محصولات مهم در ایران و بسیاری از کشورها است. بر پایۀ یک بررسی انجامشده در سال 1392 ویروس وای سیبزمینی به عنوان ویروس غالب آلودهکنندۀ گوجهفرنگی در شهرستان یزد معرفی شده بود. در این پژوهش قسمتهایی از ژنوم یک جدایۀ انتخابی از این ویروس با نام جدایۀ T5 افزونش و توالییابی شد. پس از استخراج RNA کل از نمونۀ T5، با استفاده از آزمون RT-PCR نواحی مختلف CP، NIb و P1 به کمک جفت آغازگرهای CPf/CPr، M4T/Sprimer و P1/P2 افزونش و به ترتیب سه قطعه به طول 824، 1700 و 837 جفت بازی توالییابی شد. نتایج بهدستآمده از بررسی و مقایسۀ توالی آمینواسیدی و نوکلئوتیدی نواحی P1، CP و NIb با دیگر توالیهای موجود در بانک ژن، نشان داد که جدایۀ T5 متعلق به سویۀNTN است.
