نسب‏شناسی ژنی برای قطعه ‏توالی‏های افتراقی بیان‌شده Trichoderma harzianum در طول کلونیزه‌شدن اسپرموسفر و سطح ریشة گوجه‏ فرنگی

نویسندگان

1 استاد بیماری‏ شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

2 استادیار بیماری‏ شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران

3 دانشیار بیماری‏ شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

doi
10.22059/ijpps.2014.52258
چکیده

بعضی سویه‏های تریکودرما به عنوان عامل کنترل بیولوژیک علیه بیمارگرهای گیاهی استفاده شده‌اند. روش نمایش افتراقی تکثیر نسخه‏های معکوس mRNA (DDRT-PCR) استفاده شد تا ژن‏های متمایز بیان‌شدة سویة T. harzianum T7 در طول مراحل کلونیزه‌شدن اسپرموسفر و سطح ریشه گوجه ‏فرنگی ردیابی شود. تولیدات DDRT-PCR روی ژل ‏آگارز تفکیک و 42 باند افتراقی برش خالص‏سازی، همسانه ‏سازی و توالی‏یابی شد. قطعه ‏توالی‏ های بیان‌شده به‌دست آمده با استفاده از جست‌وجوی BLAST2GO به پایگاه اطلاعات NCBI معرفی و نسب‏شناسی ژنی آنها بررسی شد. اغلب قطعه‏ توالی‏های بیان‌شده‏ مرتبط با پروتئین‏های شناخته شده یا فرضی بود. این پروتئین‏ها مرتبط با گروه‏ های کارکردی مختلف بودند و عمدتاً در سوخت‌وساز، انتقال سیگنال درون و بین‌سلولی، برهم‌کنش با میزبان، انتقال پروتئین، ترجمة پروتئین‏ها، کنترل رشد و بقای سلولی، عادت به تغییرات محیطی، انتقال مولکول‏های زیستی بین هسته و سیتوپلاسم، تنظیم کارکرد پروتئین‏ها، تقسیم سلولی، تسریع در واکنش‏های آنالوگ، تعمیر مولکول‏های آسیب‌دیده DNA و دیگر کارکردهای حیاتی در موجودات مختلف نقش داشتند. بعضی قطعه ‏توالی‏های بیان‌شده ردیابی‌شده در این مطالعه مرتبط با ژن‏هایی بودند که آنزیم‏های درگیر در تأمین غذایی تریکودرما را در زیستگاه‌شان کد می‏کنند.

کلیدواژه‌ها