نسبشناسی ژنی برای قطعه توالیهای افتراقی بیانشده Trichoderma harzianum در طول کلونیزهشدن اسپرموسفر و سطح ریشة گوجه فرنگی
نویسندگان
1 استاد بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران
2 استادیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران
3 دانشیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران
doi
10.22059/ijpps.2014.52258چکیده
بعضی سویههای تریکودرما به عنوان عامل کنترل بیولوژیک علیه بیمارگرهای گیاهی استفاده شدهاند. روش نمایش افتراقی تکثیر نسخههای معکوس mRNA (DDRT-PCR) استفاده شد تا ژنهای متمایز بیانشدة سویة T. harzianum T7 در طول مراحل کلونیزهشدن اسپرموسفر و سطح ریشه گوجه فرنگی ردیابی شود. تولیدات DDRT-PCR روی ژل آگارز تفکیک و 42 باند افتراقی برش خالصسازی، همسانه سازی و توالییابی شد. قطعه توالی های بیانشده بهدست آمده با استفاده از جستوجوی BLAST2GO به پایگاه اطلاعات NCBI معرفی و نسبشناسی ژنی آنها بررسی شد. اغلب قطعه توالیهای بیانشده مرتبط با پروتئینهای شناخته شده یا فرضی بود. این پروتئینها مرتبط با گروه های کارکردی مختلف بودند و عمدتاً در سوختوساز، انتقال سیگنال درون و بینسلولی، برهمکنش با میزبان، انتقال پروتئین، ترجمة پروتئینها، کنترل رشد و بقای سلولی، عادت به تغییرات محیطی، انتقال مولکولهای زیستی بین هسته و سیتوپلاسم، تنظیم کارکرد پروتئینها، تقسیم سلولی، تسریع در واکنشهای آنالوگ، تعمیر مولکولهای آسیبدیده DNA و دیگر کارکردهای حیاتی در موجودات مختلف نقش داشتند. بعضی قطعه توالیهای بیانشده ردیابیشده در این مطالعه مرتبط با ژنهایی بودند که آنزیمهای درگیر در تأمین غذایی تریکودرما را در زیستگاهشان کد میکنند.