شناسایی و بررسی بیان ریز RNAهای حفاظتشده مرتبط با تنش شوری در عدس (Lens culinaris L.)
نویسندگان
1 گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباد، ایران
2 گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباد، ایران
3 گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباد، ایران
4 گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباد، ایران
5 گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباد، ایران
doi
چکیده
میکرو RNAها، خانوادهای از ریز RNAها هستند که بیان ژنها را در سطح پس از رونویسی با تخریب mRNA یا ممانعت از ترجمه تنظیم میکنند. گرچه تاکنون هزاران میرنا در گونههای مختلف گیاهی شناساییشده است با این حال، اطلاعاتی از وجود میرناهای حفاظتشده مرتبط با تنش شوری در عدس که یکی از مهمترین و پرمصرفترین محصولات زراعی در ایران و کشورهای در حال توسعه بهشمار میرود، گزارش نشده است. مطالعه حاضر بهمنظور شناسایی میرناهای محافظتشده بالقوه و ژنهای هدف آنها در ترنسکریپتوم گیاه عدس تحت تنش شوری انجام شد. در این مطالعه، 55892 یونی ژنی که از فرآیند سرهمبندی نوپدید، مجموع خوانشهای کوتاه مشتق شده از توالییابیRNA عدس تحت دو شرایط کنترل و تنش شوری صورت گرفته بود برای پیشبینی miRNAهای حفاظتشده و ژنهای هدف آنها استفاده شد. در نهایت از بین توالیهای کاندید شش میرنای محافظتشده با پتانسیل بسیار بالا پس از اعمال فیلترهای سختگیرانه شناسایی شدند. میرناهای شناساییشده دارای بیان متفاوتی در تنش شوری بودند. نتایج نشان داد که ژنهای هدف میرناهای شناسایی شده در اغلب فرآیندهای زیستی همچون تمایز، رشد و نمو، انتقال پیام و پاسخ به تنشهای زیستی و غیرزیستی، نقش مهمی ایفا میکنند. علاوهبر این نتایج نشان داد که برخی از عوامل رونویسی متعلق به خانوادههای SBP، C2H2، GRAS، M-type_MADS و MYB بهطور وسیعی تحت تاثیر فرآیند تنظیمی میرناهای شناسایی شده قرار میگیرند. مجموعه میرناها و ژنهای هدف شناسایی شده در مطالعه حاضرمیتواند بهعنوان پایهای مفید برای پژوهشهای عمیقتر و دقیقتر در مورد نقش میرناها در پاسخ به تنش شوری عدس محسوب شوند.