مقایسه ژنوتیپی جدایههای اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال جدا شده از ماکیان صنعتی ایران
نویسندگان
1 استاد گروه بیماریهای طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
2 دانشیار گروه تحقیقات و تشخیص بیماریهای طیور، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمرازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
3 دانشجوی دکتری تخصصی بیماریهای طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
4 استادیار گروه تحقیقات و تشخیص بیماریهای طیور، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمرازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
5 دانشیار گروه تحقیقات و تشخیص بیماریهای طیور، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمرازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
doi
10.22055/ivj.2022.325609.2437چکیده
اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال (ORT)، باکتری نوظهور بیماریزای تنفسی است که خسارات اقتصادی مهمی را در صنعت طیور ایجاد میکند. مطالعات قبلی در ایران شباهتهای مولکولی و ژنتیکی بالایی را بین جدایههای ORT طی سالهای 1999-2009، براساس SDS-PAGE، ERIC-PCR و تعیین توالی ژن 16S rRNA نشان داد. هدف از مطالعه حاضر تعیین ژنوتیپ جدایههای ORT به دست آمده از ماکیان صنعتی با استفاده از روشهای تکثیر تصادفی پلیمورفیسم DNA (RAPD) و تعیین تیپ توالییابی چندجایگاهی (MLST) بود. در این مطالعه، از 30 باکتری ORT جدا شده از ماکیان صنعت طیور ایران در سالهای 1379 تا 1395 تأیید شده بهروش بیوشیمیایی و مولکولی استفاده شد. آزمایش RAPD با استفاده از پرایمر OPG11 بر روی تمام نمونههای ORT مورد مطالعه انجام شد. با توجه به نتایج آزمون RAPD از بین 30 جدایه ORT تنها 5 جدایه برای آزمون MLST انتخاب شدند که برای انجام آن، هفت جفت پرایمر برای تکثیر و توالییابی ژنهای خانهدار adk، aroE، fumC، gdhA، mdh،pgi و pmi طراحی گردید. در آزمون RAPD با استفاده از پرایمرOPG11 ، تعداد 9 ژنوتیپ متفاوت مشاهده شد. توالی DNA اللهای این هفت لوکوس، در خصوص هر 5 سویه ORT، با توالی آللهای موجود در بانک اطلاعاتی MLST مقایسه شدند. چهار ORT از پنج جدایه مورد مطالعه متعلق به تیپ سکانسی 9 (ST9) بودند و یک سویه هم تیپ سکانسی جدیدی بود. بر اساس یافتههای این مطالعه، یک تیپ سکانسی جدید از ORT های طیور صنعتی در ایران گزارش گردید که پیش از این از سایر نقاط جهان گزارش نشده است. مطالعات بعدی جهت بررسی تعداد بیشتری از جدایههای ORT، میتواند در تشخیص تیپهای مختلف سکانسی و تیپ سکانسی غالب در کشور کمککننده باشد.