تعیین هویت مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی ویروس طاعون نشخوارکنندگان کوچک در سالهای 95 و 97 در استان قم
نویسندگان
1 استاد گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
2 استاد گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
3 استادیار مؤسسه تحقیقات و سرم و واکسنسازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
4 مشاور میکروبیولوژیست مولکولی، بخش فنآوریهای هستهای سازمان خواربار و کشاورزی در مواد غذایی و کشاورزی، آزمایشگاه سایبرزردورف، وین، اتریش
5 دانش آموخته دکتری تخصصی بیماریهای درونی دامهای بزرگ، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
6 استاد گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
7 استادیار مؤسسه تحقیقات و سرم و واکسنسازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
doi
10.22055/ivj.2019.192722.2162چکیده
طاعون نشخوارکنندگان کوچک (PPR) بیماری ویروسی بسیار واگیر، شدید و کشنده نشخوارکنندگان کوچک است. چهار دودمان (Lineage) ویروس PPR بر اساس تحلیل توالی ژن نوکلئوپروتئین (N) و فیوژن (F) شناخته شده است. هدف از این مطالعه، بررسی تعیین هویت مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی ویروس طاعون نشخوارکنندگان کوچک در رخدادهای PPR سالهای 95 و 97 در استان قم بوده است. 10 نمونهی بافتی (غدد لنفاوی مزانتر) پس از کالبدگشایی از حیوانات مشکوک بالینی جمعآوری شد و وجود ویروس PPR با روش RT-PCR یک مرحلهای مورد بررسی قرار گرفت. بررسی توالی قطعهای از ژن نوکلئوپروتئین (N) و آنالیز فیلوژنتیکی نمونههایی که در RT-PCR مثبت بودند جهت تعیین دودمان جدایهها انجام گرفت. از 10 نمونه بالینی مورد بررسی، 40 درصد آنها بر اساس بررسی اسید نوکلئیک ویروس با روش RT-PCR مثبت بودند. آنالیز توالی نوکلئوتیدی و تجزیه فیلوژنتیکی جدایهها نشان داد که جدایههای به دست آمده در ردهی آسیایی (دودمان IV) ویروس PPR قرار دارد. نتایج فیلوژنتیک این مطالعه، حضور ویروس PPR دودمان IV را در میان دامهای مبتلا به طاعون نشخوارکنندگان کوچک استان قم، تأیید میکند. بنابراین این مطالعه نشان میدهد که جدایههای PPRV ایران به دودمان چهارم مربوط میشوند و با جدایههای PRPV پاکستان، تاجیکستان و هند ارتباط نزدیک دارند. توصیه میشود به منظور ترسیم دقیقتری از وضعیت حضور و چرخش دودمان یا دودمانهای ویروس PPR در ایران، مطالعات بیشتری از دیگر مناطق کشور به خصوص نواحی مرزی انجام گیرد.