توالی نوکلئوتیدی و تجزیه ژنتیکی قطعه کوچک ژنومی دو جدایه ایرانی ویروس لکه زرد زنبق(IYSV) از تره و پیاز
نویسندگان
1 عضو هیات علمی، تهران، بلوار کشاورز، بین کارگر و جمالزاده، پلاک 346 ، طبقه 5 واحد 19 ، شرکت بازرسی تاک
2 گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس
3 عضو هیات علمی پژوهشکده گل و گیاهان زینتی/ رییس
4 دانشگاه تربیت مدرس
doi
10.22034/ijpp.2022.554345.387چکیده
ویروس لکه زرد زنبق (Iris yellow spot virus, IYSV) یکی از گونههای گروه تبارزائی یوراسیایی جنس Orthotospovirus است که مشابه سایر گونههای این جنس، از نظر ژنومی دارای سه قطعه ژنومی کوچک (S) ، متوسط (M) و بزرگ (L) است. در مطالعه حاضر توالی کامل قطعه کوچک دو جدایه ویروس از میزبان تره ایرانی (Allium ampeloprasum) (IYSV-Le1M) و پیاز (A. cepa) (IYSV-O2K) و نیز ژن غیر ساختمانی قطعه متوسط (M) جدایه IYSV-Le1M تعیین شد. نتایج نشان داد که بر اساس توالی آمینواسیدی ژنهای نوکلئوکپسید (N)، غیر ساختمانی قطعه کوچک (NSs) و غیر ساختمانی قطعه متوسط (NSm)، جدایههای استان مرکزی نسبت به سایر جدایههای ویروس لکه زرد زنبق بیشترین قرابت را با یکدیگر دارند. با این حال منطقه بین ژنی (Intergenic Region, IGR) قطعه آر ان ای کوچک این دو جدایه با سایر جدایههای تعیین توالی شده ویروس لکه زرد زنبق تفاوتهای ساختمانی مشخصی را نشان داد. منطقه بین ژنی جدایه تره ایرانی دارای بیشترین طول در بین جدایه های ویروس لکه زرد زنبق تعیین توالی شده بود، این ناحیه در جدایه پیاز 440 نوکلئوتید و در جدایههای هندی و هلندی به ترتیب 31 و 22 نوکلئوتید نسبت به جدایه تره ایرانی کوتاهتر بودند. یافتههای بررسی حاضر اطلاعات جدیدی در خصوص تنوع ژنتیکی و تبارزایی جدایه های ویروس لکه زرد زنبق ارایه میدهد.