فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

جنس Begomovirus بزرگترین جنس در خانواده Geminiviridae است. در این مطالعه، یک نمونه ختمی با علائم مشکوک به آلودگی بگوموویروس‌ها شامل کوتولگی و پیچیدگی شدید برگ از شهرستان‌ جیرفت جمع‌آوری گردید و استخراج دی‌اِن‌‌اِی کل به روش CTAB، براساس دستورالعمل ارائه شده انجام شد. آلودگی این نمونه با روش توالی‌یابی نسل جدید مورد بررسی قرار گرفت. پس از واکاوی اطلاعات NGS، ویروس جزیرای پیچیدگی برگ پنبه (Cotton leaf curl Gezira virus, CLCuGV) و Cotton leaf curl Gezira betasatellite مرتبط با آن از نمونه ختمی بازیابی شد. سپس ژنوم کامل ویروس و بتاستلایت همراه به روش دایره غلتان و با استفاده از کیت آرسی‌اِ تکثیر و سپس همسانه‌سازی و تعیین ترادف گردید. نتایج حاصل از تعیین ترادف، آلودگی گیاه ختمی به ویروس جزیرای پیچیدگی برگ پنبه و بتاستلایت مرتبط به آن را تایید کرد. بر این اساس، طول ژنوم جدایه ایرانی این ویروس و بتاستلایت همراه، به ترتیب 2761 و 1355 نوکلئوتید بدست آمد. به منظور شناسایی سایر میزبان‌های ویروس جزیرای پیچیدگی برگ پنبه، یک نمونۀ آفتاب گردان با علائم شدید چروکیدگی و فنجانی شدن برگ از مزارع دزفول استان خوزستان و پنج نمونۀ بامیه با علائم پیچیدگی شدید برگ از گلخانه‌ها و مزارع جیرفت استان کرمان جمع‌‌آوری شد. آلودگی نمونه‌های فوق به CLCuGV با استفاده از واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز و جفت آغازگرهای اختصاصی اثبات گردید و یک قطعۀ 730 جفت بازی تکثیر شد. وجود بتاستلایت همراه با CLCuGV در نمونه های بامیه و آفتاب گردان نیز با همسانه سازی و تعیین ترادف محصول آر سی اِ اثبات گردید.