همسانه¬سازی مولکولی، جداسازی و توصیف یک ژن پکتات لیاز از بافت حبه انگور بی¬دانه سفید (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid)
نویسندگان
1
2
3
4
5
doi
چکیده
یکی از فعالیتهای مهم سلولهای گیاهی در دوره رشد آن، فعال نمودن ژنهای عامل و آنزیمهای موثر در تجزیه برخی مواد ذخیره شده در مراحل اولیه تشکیل میوه است. بر اساس مطالعات انجام شده، آنزیمهای مختلفی در تخریب دیواره سلولی و نرم شدن بافت میوه نقش دارند. از مهمترین این آنزیمها، آنزیم پکتات لیاز میباشد. در این مطالعه، cDNA ناقص یکی از ژنهای پکتات لیاز از بافت حبه انگور بیدانه سفید ( Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیرهای پلیمراز نسخهبرداری معکوس (Reverse Transcriptase-PCR) جداسازی و در ناقل pUC19 همسانهسازی و ساختار مولکولی، ویژگیهای بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی این ژن، تحت عنوان Vv Pel 1، بهطول bp429 بوده و یک پروتئین با 143 اسیدآمینه را رمز میکند. وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه ایزوالکتریک پیشبینی شده این پروتئین بهترتیب برابر 78/15 کیلو دالتون و 53/6 میباشد. بررسی ساختارهای دوم و سوم توالی پروتئینی Vv Pel 1 نشان داد که این پروتئین از نظر ساختاری مشابه با توالیهای پکتات لیاز گزارش شده از موجودات دیگر میباشد. توالی پروتئینی بهدست آمده شباهت زیادی را با توالیهای پکتات لیاز سایر گیاهان از قبیل Ricinus communis ، Fragaria ananassa ، Prunus persica و Populus trichocarpa نشان داد. بررسی فیلوژنتیکی نیز مشخص کرد که این ژن به زیرگروه I پکتات لیازهای گیاهی تعلق دارد.