تاثیر پرتودهی سلول های سرطانی رده MCF-7 بر فعال شدن مسیر گیرنده شبه NOD : رویکرد بیوانفورماتیکی
نویسندگان
1 گروه فیزیولوژی ، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی جهرم، جهرم، ایران
2 کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی جهرم، جهرم، ایران
3 1. مرکز تحقیقات بیماریهای غیر واگیر، دانشگاه علوم پزشکی جهرم، جهرم، ایران گروه بیوشیمی و تغذیه، گروه علوم و فناوریهای نوین پزشکی،
doi
10.22034/pjms.2025.2074414.1248چکیده
مقدمه: سرطان سینه از شایعترین سرطانها در زنان جهان است. مطالعه حاضر داده های ریزآرایه سلولهای MCF-7 که به مدت 72 و 96 ساعت پرتودهی شده اند انالیز مجدد نمود تا مسیرهای سلولی مهم تشخیص داده شوند.روش کار: دادههای ریز آرایه سلول های MCF-7 که در دو بازه زمانی 72 و 96 ساعت تحت پرتو یونیزان با شدت 6Gy قرار گرفته بودند انتخاب و توسط نرم افزارR مورد تحلیل قرار گرفتند. سپس ژنهایی که تفاوت بیان داشتند استخراج و تحلیل بیان ژن در مورد آنها انجام شد.یافتهها: در این مطالعه پس از 72 و 96 ساعت پرتودهی به ترتیب 274 و 531 ژن با Log2FC>1 افزایش بیان و 174 و 649 ژن با Log2FC<-1 کاهش بیان داشتند (Adjusted p value <0.05 ). آنالیز عملکرد نشان داد که پس از 72 ساعت پرتودهی ژن های افزایش بیان یافته با مسیر پیام رسانی گیرنده شبه NOD مرتبط می باشد. ژن های استخراج شده در این مسیر شامل TXNIP ، IRF3/7، OAS ، TNFα ، LC3، GBPs ، CXCL،IL8 ، IRF9،JAK1 و STAT1/2 بودند (Adjusted p value <0.05 ). همچنین یافته ها نشان می دهد که پس از 96 ساعت پرتودهی بیشترین تعداد فرآیند بیولوژیک مشاهده شده برای ژن هایی که افزایش بیان داشته اند در ارتباط با انتقال سیگنال می باشد..نتیجهگیری: تحلیل ژنهای افزایش بیان یافته پس از ۷۲ ساعت پرتودهی، فعال شدن مسیر پیام رسانی گیرنده شبه NOD را نشان داد که احتمالا می تواند مرتبط با مسیرهای مولکولی آسیب به DNA و فعالسازی پاسخهای ایمنی ذاتی باشد.