طراحی نانوبیوسنسور فلورسانسی جهت تشخیص زودهنگام سرطان کلورکتال با استفاده از کاوشگرهای APC و miR-21-5p به طور همزمان

نویسندگان

1 گروه زیست شناسی واحد ورامین پیشوا. دانشگاه آزاد اسلامی واحد پیشوا، ورامین، ایران

2 مرکز تحقیقات میکروبیولوژی کاربردی، انستیتو سیستم بیولوژی و مسمومیت ها، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله (عج) تهران، ایران

3 گروه زیست شناسی، دانشکده علوم زیستی، واحد تهران شمال. دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.

4 گروه زیست شناسی، دانشکده علوم زیستی، واحد تهران شمال. دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

5 گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم زیستی، واحد تهران شمال. دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

doi
10.22034/pjms.2023.708641
چکیده

مقدمه: ژن APC در ctDNA و miR-21-5p به عنوان نشانگرهای زیستی بالقوه برای تشخیص سرطان پیشنهاد شده اند.روش کار: در این مطالعه فوق یک نانوحسگر زیستی مبتنی بر نانولوله کربنی چند دیواره (MWCNT) و پروب DNA دارای ماده فلوئوروفورFAM (6- کربوکسی فلورسین) برای تشخیص ژن APC در ctDNA ، و پروب DNA دارای ماده فلوئوروفور ROX (5-کربوکسی-x-رودامین) برای تشخیص miR-21-5p، برای شناسایی بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال (CRC) طراحی شده است. این روش مبتنی بر جذب و تثبیت DNA تک رشته ای (ssDNA) نشاندار شده با FAM و ROX بر روی MWCNT است که منجر به خاموش شدن نشر فلورسانسیFAM و ROX می شود. با افزودن DNA های مکمل آن ها(cDNA) ، که منجر به آزادسازی پروب های DNA تک رشته ای (ssDNA) از سطح MWCNT شده و یک DNA دو رشته ای (dsDNA) تشکیل شده که منجر به بازگشت نشرفلورسانسی FAM و ROXگردید. یافته ها: در این مطالعه، حساسیت فلوروفور FAM  نانومولار(50 nM) و حساسیت فلوروفور ROX، نانومولار( ( nM25) به دست آمد. مدت زمان پاسخ دهی در حضور رشته هدف 12دقیقه است. LOD و LOQ بیوسنسور DNA به صورت تکی به ترتیب 1.12 نانومولار و 3.2 میکرومولار به دست آمد.نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که نانوحسگر زیستی مبتنی بر نانولوله‌های کربنی و پروب DNA ، علاوه بر روش‌های موجود، می‌تواند به عنوان یک روش با حساسیت بالا برای تشخیص زودهنگام CRC مورد استفاده قرار گیرد.