انتقال دهنده پلی آمین ATP13A2 و کووید 19: یک مطالعه مبتنی برداده های ریز آرایه و تحلیل عملکرد

نویسندگان

1 گروه بیوشیمی، گروه علوم و فناوری های نوین پزشکی،دانشگاه علوم پزشکی جهرم، جهرم، ایران

2 گروه بیوشیمی، گروه علوم و فناوری های نوین پزشکی، مرکز تحقیقات بیماری های غیرواگیر، دانشگاه علوم پزشکی جهرم، جهرم، ایران

doi
10.22034/pjms.2022.700479
چکیده

مقدمه : پاندمی کووید- 19 افراد زیادی را مبتلا کرده و موجب مرگ و میر بسیاری نیز شده است. هنوز سازوکار دقیق عمل ویروس عامل این بیماری در بدن مشخص نیست. هدف از مطالعه حاضر بررسی و تحلیل داده های ریز آرایه و همچنین یافتن سازوکارهای جدید عملکرد این ویروس در سلول های انسان بود.روش کار: داده های ریز آرایه استخراج شده از NCBI توسط GEO2R و نرم افزار R مورد تحلیل قرار گرفتند. ژن هایی که افزایش و کاهش بیان داشتند استخراج و تحلیل عملکرد در مورد آن ها انجام شد.یافته ها : نتایج نشان داد که در سطح لگاریتم پایه دو تغییر بیان بزرگتر از 3 و کوچکتر از 3- ترانس کریپتوم،   319 و 573 ژن افزایش بیان داشته اند که به ترتیب مربوط به گروه بیماران کووید خفیف و کووید شدید بود. همچنین 156 و 590 ژن کاهش بیان داشته اند که به ترتیب در گروه بیماران کووید خفیف و کووید شدید مشاهده شد. نتایج GO نشان داد که الگوی ژن های تفاوت بیان داشته در گروه بیماران کووید شدید با ژن  ATP13A2 مرتبط است.نتیجه گیری : ویروس کووید- 19 احتمالا در تعامل با عواملی همچون  ATP13A2 شرایط بقای خود در داخل سلول تنظیم می کند.