ردیابی و تعیین خصوصیات بیولوژیکی و فیلوژنتیکی ویروس Y سیب زمینی (PVY) جدایه استان لرستان
نویسندگان
1 استادیار گروه گیاهپزشکی. دانشکده کشاورزی. دانشگاه آزاد اسلامی خرم آباد. خرم آباد. ایران
2 فارغ التحصیل رشته بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی خرم آباد. خرم آباد. ایران
3 استادیار گروه گیاهپزشکی.دانشکده کشاورزی.دانشگاه لرستان. لرستان. ایران
doi
چکیده
بیماریهای ویروسی از جمله عوامل محدودکننده تولید سیبزمینی در جهان هستند. ویروس Y سیبزمینی (PVY) گونه جنس Potyvirus از خانواده Potyviridae یکی از مهمترین بیماریهای محصول سیبزمینی میباشد. به منظور ردیابی ویروس، تعداد 135 نمونه از گیاهانی که علائم موزائیک، کوتولگی، موجی بودن حاشیه برگ، لکههای کلروتیک و تغییر شکل برگ را نشان میدادند، از مزارع سیبزمینی استان لرستان جمعآوری گردید. عصاره گیاهان مشکوک در مرحله چهار برگی روی گیاهان محکNicotiana glutinosa ، N. occidentalis وN. debneyi مایهزنی گردید. پس از حدود ده روز علایمی نظیر زردی موضعی، رگبرگروشنی و موزائیک روی N. occidentalis و پیسه ای شدن و نکروز موضعی روی N. glutinosa مشاهده شد. از گیاهان محک دارای علائم، استخراجRNA کل صورت گرفت و با استفاده از آزمون RT-PCR و آغازگرهای اختصاصی مربوط به بخشی از ناحیه ژنومی ژن CP و NIb ویروسPVY ، باندی در محدوده bp 1115 تکثیر شد و آلودگی نمونهها به ویروس PVY اثبات شد. بررسیهای فیلوژنتیکی نشان داد که جدایه ایرانی مورد مطالعه دارای 48/99-74/98 درصد همسانی ژنتیکی با دیگر توالیهای ثبت شده در این ناحیه درNCBI بود. نتایج تجزیه و تحلیلهای ژنتیکی نشان داد که جدایههای ویروس PVY در دو گروه قرار گرفتند و جدایه ردیابی شده از استان لرستان در گروه II و در کنار جدایههای مربوط به کشور آلمان که متعلق به نژاد Wilga بودند، قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی قطعه مورد نظر در NCBI به شماره دسترسی MT655949 ثبت گردید. این اولین گزارش از آلودگی مزارع سیبزمینی استان لرستان به ویروسPVY به کمک آزمایشات مولکولی میباشد.