تنوع ژنتیکی قارچ‌های اندوفیت درختچه شیرخشت (‏Cotoneaster integerrimus Medik.‎‏) ارسباران‏

نویسندگان

1 دانش‌آموخته‎ ‎کارشناسی‎ ‎ارشد، گروه زیست شناسی،‎ ‎واحد تبریز،‎ ‎دانشگاه‎ ‎آزاد اسلامی،‎ ‎تبریز، ایران

2 استادیار، دکترای تخصصی ژنتیک مولکولی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران

3 استادیار، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، مؤسسه‎ ‎تحقیقات‎ ‎جنگل‌ها‎ ‎و‎ ‎مراتع‎ ‎کشور،‎ ‎سازمان‎ ‎تحقیقات،‎ ‎آموزش‎ ‎و‎ ‎ترویج‎ ‎کشاورزی،‎ ‎تهران، ایران‏

doi
10.30466/jfrd.2022.54176.1602
چکیده

قارچ­های اندوفیت گیاهی نقش مهمی در فعل و انفعالات فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی گیاهان در پاسخ به شرایط محیطی ایفا می­کنند. در همین راستا، شناسایی قارچ­های اندوفیت گونه شیرخشت در ارسباران هدف­گذاری شد. نمونه­های برگ و ساقه از گیاه مذکور جداسازی و پس از ضدعفونی سطحی، در محیط کشت PDA حاوی استرپتومایسین کشت شدند. پس از رشد هیف­های قارچی و واکشت کردن آن­ها، از محیط کشت PDB برای ادامه کار استفاده شد. برای شناسایی ایزوله­های قارچی رشد­کرده، استخراج DNA و واکنش زنجیره­ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای نواحی فاصله­انداز رونویسی­شونده داخلی (Internal Transcribed Spacer) انجام شد. نتایج حاصل از PCR، نشان داد که از 15 ایزوله جداسازی- شده، در 9 ایزوله قطعه ITS تکثیر شد. به­طوری که 3 ایزوله در گونه Penicillium sizovae، 3 ایزوله در گونه Alternaria alternate، 2 ایزوله در جنس Penicillium و ایزوله آخر به­دلیل شباهت کم توالی ITS آن با داده پایگاه، نامگذاری نشد و احتمالا گونه جدیدی باشد و نیاز به پژوهش­های تکمیلی دارد. تجزیه­وتحلیل فیلوژنتیک، 4 گونه مورد نظر را در 2 کلاد کاملا متمایز قرار داد، به­طوری که کمترین فاصله ژنتیکی بین 2 گونه Penicillium و بیشترین فاصله نیز بین 2 ایزوله Penicillium sp و Fungal sp وجود دارد. این بررسی اولین گزارش در ارتباط با قارچ­های اندوفیت شیرخشت بوده و نشان می­دهد که این گونه گیاهی میزبان تعداد و طیف کمی از قارچ­های اندوفیت است.