تنوع ژنتیکی قارچهای اندوفیت درختچه شیرخشت (Cotoneaster integerrimus Medik.) ارسباران
نویسندگان
1 دانشآموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران
2 استادیار، دکترای تخصصی ژنتیک مولکولی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران
3 استادیار، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
doi
10.30466/jfrd.2022.54176.1602چکیده
قارچهای اندوفیت گیاهی نقش مهمی در فعل و انفعالات فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی گیاهان در پاسخ به شرایط محیطی ایفا میکنند. در همین راستا، شناسایی قارچهای اندوفیت گونه شیرخشت در ارسباران هدفگذاری شد. نمونههای برگ و ساقه از گیاه مذکور جداسازی و پس از ضدعفونی سطحی، در محیط کشت PDA حاوی استرپتومایسین کشت شدند. پس از رشد هیفهای قارچی و واکشت کردن آنها، از محیط کشت PDB برای ادامه کار استفاده شد. برای شناسایی ایزولههای قارچی رشدکرده، استخراج DNA و واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای نواحی فاصلهانداز رونویسیشونده داخلی (Internal Transcribed Spacer) انجام شد. نتایج حاصل از PCR، نشان داد که از 15 ایزوله جداسازی- شده، در 9 ایزوله قطعه ITS تکثیر شد. بهطوری که 3 ایزوله در گونه Penicillium sizovae، 3 ایزوله در گونه Alternaria alternate، 2 ایزوله در جنس Penicillium و ایزوله آخر بهدلیل شباهت کم توالی ITS آن با داده پایگاه، نامگذاری نشد و احتمالا گونه جدیدی باشد و نیاز به پژوهشهای تکمیلی دارد. تجزیهوتحلیل فیلوژنتیک، 4 گونه مورد نظر را در 2 کلاد کاملا متمایز قرار داد، بهطوری که کمترین فاصله ژنتیکی بین 2 گونه Penicillium و بیشترین فاصله نیز بین 2 ایزوله Penicillium sp و Fungal sp وجود دارد. این بررسی اولین گزارش در ارتباط با قارچهای اندوفیت شیرخشت بوده و نشان میدهد که این گونه گیاهی میزبان تعداد و طیف کمی از قارچهای اندوفیت است.