شناسایی مسیرهای سیگنالینگ و بیومارکرهای پیش آگهی دهنده در سرطان پروستات با استفاده از روش های بیوانفورماتیک
نویسندگان
1
2
doi
10.32592/jru.8.1.36چکیده
سابقه و هدف: سرطان پروستات یکی از شایع ترین سرطان ها در مردان است و در سال 2022 با 1,466,680 مورد جدید، چهارمین سرطان ازنظر فراوانی گزارش شد . این مطالعه به بررسی بیان ژن های افتراقی و شناسایی نشانگرهای پیش آگهی دهنده در سرطان پروستات می پردازد. اهداف اصلی این تحقیق شامل شناسایی ژن های افتراقی در سرطان پروستات، تعیین فرایندهای زیستی و مسیرهای سیگنالینگ مرتبط با تومورزایی و نشان دادن ژن های مرتبط با پیش آگهی ضعیف در بیماران مبتلا به این بیماری است. مواد و روش ها: این مطالعه از روش های بیوانفورماتیک به منظور آنالیز مجموعه داده توالی یابی RNA ( RNA - Sequencing ) با کد شناسه GSE104131 استفاده کرد. نمونه های تومور پروستات با درجه بالا و نمونه های بافت سالم مجاور از 16 بیمار جمع آوری شدند. ژن های افتراقی با استفاده از ابزار GEO2R شناسایی شدند. همچنین، شبکه برهم کنش پروتئین- پروتئین برای شناسایی ژن های هاب و بررسی نقش آن ها در پیش آگهی بیماران انجام شد. یافته ها: نتایج نشان داد که 534 ژن افتراقی شناسایی شدند که ازاین بین تعداد 320 ژن افزایش یافته و 214 ژن کاهش یافته بودند. تحلیل ها نشان داد که افزایش بیان ژن های GATA6 و ABCC4 با پیش آگهی ضعیف در بیماران مبتلا به آدنوکارسینوم پروستات مرتبط است. همچنین، مسیرهای سیگنالینگ مانند «اکسیداسیون زیستی» و «ترشح انسولین» به طور معناداری در پیشرفت سرطان پروستات دخیل بودند. نتیجه گیری: افزایش هم زمان بیان GATA6 و ABCC4 می تواند به عنوان نشانگرهای کلیدی برای پیش بینی نتایج نامطلوب در بیماران عمل کند. هدف گذاری بر روی این ژن ها و مسیرهای مرتبط ممکن است راهکارهای درمانی جدیدی برای مدیریت سرطان پروستات ارائه دهد.