شناسایی توالی های جدید piRNA احتمالی در بافت بیضه ی انسان و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی
نویسندگان
1
doi
10.32592/jru.8.1.55چکیده
سابقه و هدف: : RNA های کوچک غیرکدکننده ( sncRNA ها) در سیستم تولیدمثلی مردان مطالعه شده اند. یکی از مهم ترین RNA های کوچک ( sRNA ) مورد مطالعه در اسپرم زایی، piRNA ها هستند. در این مطالعه، تجزیه وتحلیل جامع و مقایسه ی پروفایل بیان توالی های sRNA جدید، که حدس زده می شود piRNA باشند، در بافت بیضه ی مردان جهت شناسایی توالی های sRNA جدید انجام شده است. مواد و روش ها: جهت کشف توالی های جدید، از مجموعه ی داده ی GSE248576 در NCBI-GEO استفاده شد. سپس، با ابزار میراندا ( Miranda ) ژن های هدف بالقوه برای توالی های کشف شده پیشگویی شد. درنهایت، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، مسیرهای تنظیمی مرتبط با اسپرماتوژنز به دست آمد. یافته ها: در این مطالعه، 208 عدد توالی sRNA جدید به مثابه ی piRNA که تاکنون در پایگاه داده های مربوط به توالی های کوچک گزارش نشده اند در بافت بیضه ی مردان شناسایی شد؛ در تجزیه و تحلیل آنتولوژی ژن، مسیرهای KEGG و Reactome و تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین - پروتئین، ترم های ( terms ) مرتبط با فرایندهای تنظیمی میتوز و میوز و رشد سلولی در گامتوژنز مشخص شد. نتیجه گیری: توالی های sRNA جدید یافته شده و ژن های پیشگویی شده ی هدف آن ها، در این مطالعه می توانند کاندیدهای امیدبخشی جهت بررسی نقش آن ها در اسپرماتوژنز اختلال یافته به مثابه ی یک فنوتیپ ناباروری در مردان باشند.