کارآیی روش‌های استخراج RNA از برگ گیاه دارویی سرخارگل

نویسندگان

1 بخش تحقیقات سلولی مولکولی، مدیریت بیوتکنولوژی کشاورزی منطقه مرکزی کشور- اصفهان، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات،

2 بخش تحقیقات ژنومیکس، مدیریت بیوتکنولوژی کشاورزی منطقه مرکزی کشور- اصفهان، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران

doi
10.22034/aej.2019.665295
چکیده

سرخارگل گیاه دارویی ارزشمند حاوی سطوح بالایی از متابولیت های ثانویه می باشد که تا کنون روش مناسبی جهت استخراج RNA کل از آن معرفی نشده است. در پژوهش حاضر چهار روش استخراج RNA شامل روش لیتیم کلراید، کیت RNAX-Plus، فنل/SDS و لیتیم کلراید/فنل مورد بررسی قرار گرفت. به منظور تأیید کیفیت و خلوص RNA از روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز روی ژل آگارز 5/1% استفاده شد. نسبت بالای جذب محلول RNA در طول‌موج 260 نانومتر به طول موج 280 و 230 نانومتر، مشاهده RNA های ریبوزمی و عدم مشاهده اسمیر روی ژل به عنوان معیاری برای تعیین کیفیت نمونه‌ها در نظر گرفته شد. بالاترین کیفیت RNA حاوی 9/2 میکروگرم بر میکرولیتر در 100 میلی‌گرم برگ تازه در روش فنل/SDS و کمترین کیفیت RNA حاوی 2/1 میکروگرم در 100 میلی‌گرم برگ تازه در روش لیتیم کلراید/فنل مشاهده شد. بنابراین، روش فنل/SDS به عنوان مناسب ترین روش برای استخراج RNA برگ گیاه سرخارگل معرفی می گردد