مطالعه فارماکولوژی شبکهای از مسیرهای سیگنالدهی و ژنهای هدف ماده بربرین در درمان سرطان تخمدان با استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی
نویسندگان
1 گروه علوم جانوری و زیست شناسی دریا، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
2 گروه علوم جانوری و زیست شناسی دریا، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
3 گروه علوم جانوری و زیست شناسی دریا، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
doi
10.60833/ascij.2024.1106105چکیده
سرطان تخمدان یکی از بیماریهای کشنده در زنان میباشد که تشخیص زودهنگام آن مشکل است. بنابراین، نیاز فوری به عوامل شیمیایی وجود دارد که میتواند در کنترل توسعه سرطان تخمدان کمک کند. بربرین، به عنوان یک ماده شیمیایی، دارای خواص آنتی اکسیدانی و دارویی متعددی است و نقش ضد سرطانی این ماده تحت پژوهش قرار دارد. هدف این مطالعه تجزیه و تحلیل ژنهای هدف بربرین در سرطان تخمدان و شناخت مسیرهای سیگنالدهی بربرین با استفاده از فارماکولوژی شبکه است. در این مطالعه، مجموعه داده GSE36668 از پایگاه داده GEO گرفته شد. ژنهای دارای بیان افتراقی(DEGs)، توسط GEO2R با 05/0 adj Pvalue < و 2≤∣logFC∣ مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. اهداف مرتبط با بربرین از پایگاههای داده SwissTargetPrediction و Pharm Mapper جمعآوری شدند. شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین (PPI) اهداف مشترک بربرین و DEGs، بر اساس دادههای موجود در پایگاه داده String و با استفاده از نرمافزار Cytoscape ترسیم شد. ژنهاي مشترك در بربرین و سرطان تخمدان، در بررسی مسیرهاي زیستی (BP) و مولکولی (MF) و سلولی استفاده شدند. 10 ژن هاب انتخابی در این مطالعه شامل ESR1، STAT1، CDK1، RXRA، PIK3CA، PGR، CCNB1، CHEK1، PIK3R1 و PIK3CG بودند. همچنین مشخص شد ژنهای هدف بربرین میتوانند در مسیرهاي سیگنالدهی سرطان، سرطان زایی شیمیایی، تنش برشی سیال و آترواسکلروز، بلوغ تخمک با واسطه پروژسترون و مسیر سیگنالینگ PPAR، نقش داشته باشند. بر اساس این یافتهها بربرین میتواند بر بیان ژنهاي موثر در سرطان تخمدان و محصولات پروتئینی آنها اثر داشته و با اثر بر مسیرهاي زیستی دخیل در این بیماری، راهکار مناسبی براي درمان سرطان تخمدان باشد.