فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

سال‌هاست نژادهای بومی بسیار مورد توجه قرار دارند و تلاش‌های زیادی برای حفظ این نژادها انجام می‌شود. مطالعه و ارزیابی ساختار جمعیت و تنوع یکی از راه‌های حفاظت از ذخایر ژنتیکی است. با توجه به اهمیت حفظ نژادهای مختلف اسب ایرانی ما نیز در این مطالعه به بررسی اندازه موثر جمعیت در اسب نژاد کرد پرداختیم. یکی از پارامترهای مهم برای بررسی ساختار جمعیت اندازه موثر جمعیت است. بدین منظور، عدم تعادل لینکاژی را با استفاده از اطلاعات نشانگرهای تک‌نوکلئوتیدی حاصل از تراشه‌های متراکم 70k در اسب نژاد کرد تخمین زدیم. در ابتدا بروی 65157SNP اولیه مراحل کنترل کیفیت داده‌ها توسط نرم‌افزار Plink (mind> 0.05، geno>0.05، MAF<0.01، hwe< 10-6) انجام گرفت و بدنبال آن تعدادی از داده‌ها حذف شدند و در نهایت تعداد 56012 SNP کروموزم‌های اتوزوم برای ادامه آنالیزها باقی ماندند. LD‌با استفادها از آماره‌ r2 تخمین زده شد و از این اطلاعات برای تخمین اندازه موثر جمعیت استفاده شد. r2 در فاصله‌ی 0 تا 5/2 kb‌ بیشترین مقدار را داشت که با افزایش فاصله بین نشانگرها کاهش نشان داد. متوسط r2 در تمام کروموزوم‌ها 046/0 تخمین زده شد و محدوده‌ی آن از 041/0 تا 052/0 در بین کروموزوم‌ها تخمین زده شد. همچنین اندازه موثر در 4463 نسل قبل 6674 تخمین زده شد که در نسل حاضر نیز به 26 رسید.