تایپینگ مولکولی و تعیین روابط ژنتیکی جدایه های E.coli O157:H7 با تکنیکRAPD-PCR و ارتباط الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و ژنتیکی آنها
نویسندگان
1 گروه میکروبیولوژی، واحد شیراز، دانشگاه آزاد اسلامی، شیراز
2 قسمت واکسن های باکتریایی دامبزشکی سازمان تحقیقات آموزش و ترویح کشاورزی موسسه رازی
3 گروه میکروبیولوژی، واحد شیراز، دانشگاه آزاد اسلامی ، شیراز
4 بخش باکتری شناسی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی شیراز
5 دانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم، گروه میکروبیولوژی
doi
10.30495/jmw.2022.1969083.2041چکیده
سابقه و هدف: اشریشیاکلی O157:H7 پاتوژن مهم غذایی است که منجر به بیماری های شدید گوارشی و مرگ می شود. گاو مخزن اصلی این باکتری می باشد و طی مراحل کشتار وارد زنجیره غذایی می شود. شناسایی منبع آلودگی نقش مهمی در کنترل باکتری ایفا می کند. هدف از این مطالعه، تایپینگ مولکولی و تعیین روابط ژنتیکی جدایه های E.coli O157:H7 با تکنیکRAPD-PCR و بررسی ارتباط الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی و ژنتیکی آن ها می باشد.مواد و روش ها: بهمنظور تعیین روابط ژنتیکی جدایه ها از تکنیک RAPDاستفاده شد. باند های حاصل از واکنش، ردیابی و پروفایل های متعددی از DNA ترسیم شد. نتایج با نرم افزار NTSYSpc آنالیز و ارتباط ژنتیکی جدایه ها بر اساس ضریب تشابه تعیین گردید. الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی با تکنیک دیسک دیفیوژن بررسی شد.یافته ها: اکثر جدایه ها به هفت آنتی بیوتیک حساسیت نشان دادند و در شش سویه مقاومت مشاهده شد. انگشت نگاریDNA ، 10الگوی ژنتیکی را نشان داد. جدایه ها از منابع مختلف بر اساس شباهت در الگوی RAPD خوشه بندی شدند. سویه ها حاوی الگوی DNA متفاوت و فاصله ژنتیکی بالا، الگوهای متفاوتی از حساسیت آنتی بیوتیکی را نشان دادند.نتیجه گیری: تنوع ژنومی متعدد، پروفایل های متمایزی از DNA را در سویه های با روابط کلونال یکسان نشان داد و الگو های متفاوت از مقاومت آنتی بیوتیکی آشکار شد. از این رو استفاده همزمان از الگوهای مقاومت آنتیب یوتیکی و تایپینگ مولکولی با تکنیک RAPD-PCR می تواند در ردیابی جدایه ها و کنترل عفونت موثر باشد.