واکنش رنگی تكثير هم‌دما به واسطه حلقه با رونويسي معكوس(RT-LAMP) به منظور شناسایی ساده و سریع کرونا ویروس حاد و شدید تنفسی 2

نویسندگان

1 گروه زیست فناوری صنعتی و محیط زیست، پژوهشکده زیست فناوری، سازمان پژوهش‌های علمی و صنعتی ایران، تهران، ایران.

doi
https://doi.org/10.82363/jmw.2025.1229433
چکیده

سابقه و هدف : تکامل و شیوع سویه‌های جدید و در حال ظهور کروناویروس حاد و شدید تنفسی 2 (SARS-CoV-2) عامل بیماری کووید-19 هنوز یک چالش بهداشتی محسوب می‌شود و روش‌های مولکولی کمک کننده هستند. اين پژوهش با هدف راه‌اندازی یک روش ساده و سریع رنگ‌سنجی واکنش تكثير هم‌دما بواسطه حلقه با رونويسي معكوس (RT-LAMP) کروناویروس انجام شد. مواد و روش ها: اين پژوهش به صورت تجربی بر روی دو RNA مصنوعی رونوشت برداری شده از دو سازه ژنی مورد مطالعه قبلی ما و یک RNA جدید سنتز شده از ژن نوکلئوکپسید SARS-CoV-2  تهیه شده از واریانت XFG انجام شد. در ابتدا اقدام به تهیه RNA سنتزی به عنوان ژن هدف برای راه اندازی واکنش RT-LAMP گردید. پس از بهینه سازی واکنش  از معرف رنگی هیدروکسی نفتول بلو استفاده و روش رنگ‌سنجی راه‌اندازی شد. همچنین واکنش رنگی RT-LAMP بر روی ژن سنتزی واریانت  XFG با موفقیت انجام گردید. از واکنش Real-time PCR نیز بر روی نمونه هاي RNA سنتز شده به منظور تایید نتایج استفاده گردید. یافته ها: روش رنگ‌سنجی RT-LAMP با موفقیت برای تشخیص نمونه‌های سنتزی SARS-CoV-2 راه‌اندازی و بهینه گردید. زمان لازم برای انجام واکنش 40 دقیقه با حد تشخیص 75 نسخه ژن هدف در واکنش تعیین گردید. نتیجه گیری: بکارگیری روش رنگ سنجی مرئی با حضور رنگ HNB در حین واکنش RT-LAMP روشی  ساده‌ و سریعتر از بکارگیری رنگ‌های فلورسانت معمول همچون سایبرگلد و سایبرگرین است و ضمن حذف زمان آشکارسازی نتایج از ایجاد آلودگی پس از پایان واکنش جلوگیری و از تولید نتیجه مثبت کاذب می‌کاهد.