بررسی تنوع ژنتیکی لاکتوباسیلوسهای جدا شده از نمونههای شیر گاو به روش RAPD-PCR
نویسندگان
1 کارشناسی ارشد، گروه میکروبیولوژی، واحد کرمان، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمان، ایران
2 استادیار، گروه میکروبیولوژی، واحد کرمان، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمان، ایران
3 استادیار، گروه میکروبیولوژی، واحد کرمان، دانشگاه آزاد اسلامی، کرمان، ایران
doi
10.30495/qafj.2021.685558چکیده
محصولات لبنی مناطق مختلف میتوانند منبعی برای سویههای جدید لاکتوباسیلوس باشند، بنابراین شناسایی مولکولی و بررسی تنوع ژنتیکی آنها میتواند گام موثری در شناسایی ذخیره لاکتوباسیلوسهای بومی با خصوصیات عملکردی ویژه و به کارگیری آنها در محصولات لبنی صنعتی شود. هدف از این تحقیق جداسازی لاکتوباسیلوسها از فلور موجود در شیر گاو شهرستان نرماشیر و بررسی تنوع ژنتیکی آنها میباشد. بدینمنظور تعداد 21 نمونه شیر از مناطق مختلف این شهرستان جمعآوری و با روشهای مرسوم فنوتیپی و بیوشیمیایی لاکتوباسیلوسها جداسازی شدند. به منظور غربالگری و بررسی تنوع ژنتیکی لاکتوباسیلوسهای جدا شده، پنج پرایمر RAPD به طور تصادفی انتخاب گردید و پس از PCR، تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی و فیلوژنتیکی با استفاده از نرمافزار Pyelph انجام و درخت فیلوژنی رسم شد. تجزیه خوشهای دادههای مولکولی توانست جدایهها را در فاصله ژنتیکی 10 به هفت گروه مجزا تقسیمبندی کند. جدایههای K3 و K4 در گروه یک و جدایههای K21 و K13 و K11 در گروه چهار قرار گرفتند. بقیه جدایهها در گروههای مجزا قرار گرفتند. از آنجائیکه جدایههای K3 و K4 از یک ناحیه و جدایههای K21 و K13 نیز از یک ناحیه جمعآوری شدهاند، قرار گرفتن آنها در یک گروه منطقی به نظر میرسد. نتایج بدست آمده از این تحقیق بیانگر تنوع ژنتیکی بالای جدایههای بومی شهرستان نرماشیر و مناسب بودن تکنیک RAPD-PCR برای مطالعات مشابه میباشد.