بررسی داکینگ مولکولی آورانتامید موجود در گیاه دارویی مورینگا الیفرا (Moringa Olifera) بر مهار پروستاگلاندین¬ها

نویسندگان

1 کارشناس ارشد پژوهشکده زیست فناوری دانشگاه زابل، زابل ایران

2 دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی دانشگاه زابل، زابل، ایران

doi
https://doi.org/10.71516/qafj.2023.1103
چکیده

درد مکانیسمی دفاعی محسوب می­شود و هنگامی که بافتی دچار آسیب شود، ایجاد می­گردد. گیرنده­های درد در پوست و بافت­ها، انتهای عصبی آزاد هستند. ایجاد درد در بافت­ها به علت ساخته شدن موادی به نام پروستاگلاندین­ها که از مهم­ترین واسطه­های التهاب می­باشد و مهار ساخت آن توسط داروهای ضد التهاب موجب کاهش آن می­شود. گیاه مورینگا الیفرا در صنایع غذا و دارو اهمیت بالایی دارد و دارای ترکیب دارویی نادر به نام آورانتی­آمید (Auranti amide) می­باشد. این ترکیب به دلیل اثرات ضدالتهابی و ضدروماتیسمی خود، در درمان بیماری­های التهابی مانند آرتروز، روماتوئید و پسوریازیس کاربرد دارد و با ممانعت از تولید پروستاگلاندین­ها و افزایش تولید گلوتاتیون، کاهش فعالیت آنزیم­های آسپارتات­آمینوترانسفراز و آلانین­آمینوترانسفراز و کاهش تولید عامل التهابی TNF-α، عوارض التهابی را کاهش می­دهد. هدف از این مطالعه بررسی اثر مهاری ترکیب دارویی اورانتامید بروی پروستاگلاندین­ها از طریق داکینگ مولکولی می­باشد. برای بررسی نحوه اتصال ترکیب دارویی به جایگاه فعال مولکول، ترسیم ساختار شیمیایی دارو، بهینه­سازی انرژی، مطالعات داکینگ، تجزیه و تحلیل­های نهایی از پایگاه داده­های Pub Chem و PDB استفاده شد. میانکنش دارو با رسپتور از طریق داک­های متفاوت با استفاده از نرم­افزار­های Pyrex، Chimera و Viewer Lite انجام شد. نتایج نشان داد که ترکیب مورد نظر قادر به اشغال جایگاه فعال آنزیم بود و در میان نرم­افزارها بهترین نتیجه با استفاده از نرم­افزار Pyrex بدست آمد. در واقع این ترکیب دارای منفی­ترین سطح انرژی اتصال (Kcal mol 5/7-) بود. بنابراین نشان داده شد که بالاترین تمایل به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال آنزیم و محل برهمکنش با مولکول کوکریستال است.