فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

دی‌اکسی‌نیوالنول (DON) رایج‌ترین مایکوتوکسین آلوده‌کننده‌ی غلات است که با روش‌های رایج نظیر جاذب‌ها قابل کنترل نیست. از این رو، روش‌های مبتنی بر آنزیم‌ها جهت سم‌زدایی این نوع مایکوتوکسین ها پیشنهاد می‌شود. هدف از مطالعه‌ی حاضر بررسی برهمکنش آنزیم‌های DEP-A و DEP-B با کموتایپ‌های مایکوتوکسین DON نظیر 15- استیل-دی‌اکسی‌نیوالنول (15ADON) از طریق داکینگ مولکولی می‌باشد. ساختار سه بعدی پروتئین های DEP-A و DEP-B با استفاده از سرور SWISS MODEL پیش‌بینی شد. سپس، پایداری این ساختارها در شرایط دینامیکی مولکولی مورد ارزیابی قرار گرفتند. بدین منظور شبیه‌سازی با کمک نرم‌افزار GROMACS انجام شد و سپس منحنی RMSDمربوط به این دو آنزیم جهت بررسی پایداری ساختار رسم شد. به‌منظور بررسی برهم‌کنش های آنزیم DEP-A با 15ADON و DEP-B با حدواسط ایجاد شده از مرحله‌ی قبل یعنیOxid 15ADON از سرور آنلاین H-DOCK استفاده شد. بررسی ساختارهای پیش‌بینی‌شده توسط پلات‌های ERRAT، Verify3D، Z-score و Ramachandran نشان داد که پیش‌بینی ساختارها با موفقیت انجام شده‌است. منحنی های RMSD نشان داد که DEP-A و DEP-B به ترتیب در 240 و 40 نانوثانیه با میزان 58/0 و 35/0 nm پایدار شده‌اند. نتایج مربوط به داکینگ مولکولی نیز نشان داد که هر دو آنزیم DEP-A و DEP-B به ترتیب با انرژی اتصال نسبتا قوی (90/157- و 78/141-) به سوبسترا متصل شده‌اند. در نهایت می‌توان نتیجه گرفت که هر دو آنزیم مورد مطالعه قادر به اتصال به کموتایپ 15ADON در جایگاه مناسب بوده که نشان می‌دهد این آنزیم‌ها می‌توانند در غیر فعال سازی این کموتایپ موثر واقع شوند. اگرچه مطالعات آزمایشگاهی به منظور تایید این نتایج مورد نیاز می‌باشد.