فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

شیوع بیماری آنفولانزای پرندگان با مرگ‌و‌میر بالا، کاهش تولید تخم و کشتن اجباری گله‌های آلوده، تأثیر مخربی بر صنعت طیور دارد. براساس پروتئین مرکزی ویروس به سه زیر گروه A,B,C تقسیم می‌شود. ویروس آنفولانزای نوع A بسیار شایع می‌باشد این ویروس می‌تواند باعث ابتلای گونه‌های مختلف پستانداران و پرندگان شود و بیماری‌زایی بیشتری نسبت به آنفولانزای ,B,C دارد و تقریباً همه ساله باعث اپیدمی با شدت‌های مختلف می‌شود. اهداف اصلاح نژادی برای حفظ سلامت حیوانات منجر به رفاه حیوانات و جلوگیری از ضررهای اقصادی می‌شود. هدف از پژوهش حاضر، استفاده از روش آنالیز شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیماری آنفولانزای مرغی می‌باشد. در این مطالعه به منظور دستیابی سریع به مهم‌ترین ژن‌های درگیر در این بیماری داده‌های ریزآرایه بیان ژن مربوط به بافت ریه جوجه‌های آلوده به ویروس از سایت GEO با شماره دسترسی GSE53931 تهیه گردید. رسم شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین توسط نرم‌افزار Cytoscape انجام شد. آنالیز کمپلکس‌های پروتئینی به کمک MCODE انجام گردید. سه کمپلکس پروتئینی استخراج شد. پروتئین‌های seed در کمپلکس‌ها عبارتند از RPL10A, NOB1, MSH4 که بعنوان نشانگر کلیدی معرفی شدند، همچنین ژن‌های NEB، RPF1، CSRNP1، RNF146، RPL18A با کم‌ترین درجه بیان و ژن‌های SLC6A20، PLN ،SLC17A8، NOXO1، TMEM179 با بیشترین درجه بیان در مطالعه حاضر می‌باشند. بیشتر ژن‌ها در رونویسی، تکثیر، ترجمه ژن در ویروس آنفولانزا نقش دارند. آنالیزهای بر پایه شبکه می‌تواند به تشخیص ژن‌های درگیر در بیماری و ماژول عملکردی بپردازد، که این امر می‌تواند کمک قابل توجهی در شناسایی عوامل تنظیم کننده و فرآیندهای زیستی دخیل در پاسخ به بیماری آنفولانزای مرغی داشته باشد.