فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

به کمک روش RNA-seq می‌توان اطلاعات کاملی در خصوص شناسایی ژن‌ها بدست آورد که نتایج آن ممکن است در ژنتیک و اصلاح دام و طیور سودمند باشد. تاکنون مطالعات کمی در خصوص استفاده از این روش در ارزیابی ترانسکریپتوم طیور بومی گزارش شده است، با توجه به اهمیت lncRNAها در فرآیندهای بیولوژیکی، در مطالعه حاضر به بررسی lncRNAهای حاصل از ترانسکریپتوم مرغ بومی اصفهان و سویه تجاری راس 708 و تفاوت بیان آن‌ها پرداخته شده است. در این مطالعه با استفاده از توالی‌یابی نسل جدید، 568 lncRNA  شناسایی شد که تغییرات بیان 116 lncRNA معنی‌دار بود (05/0 P-value ≤ P-value). نتایج نشان داد lncRNA های دارای بیان متفاوت در مسیر‌های بیولوژیکی مرتبط با متیلاسیون لایزین و هیستون، فعال‌سازی لکوسیت‌های میلوئیدی، تنظیم مثبت تولید سایتوکین و تنظیم فعال‌سازی لنفوسیت‌ها نقش دارند. آنالیز عملکرد مولکولی این ژن‌ها نشان داد فعالیت پروتئین تیروزین کیناز غیر غشایی، پروتئین متیل ترانسفراز، متیل ترانسفراز وابسته به S-آدنوزیل متیونین، و انتقال گروه‌های یک کربنی و اتصال گیرنده سیگنال به طور معنی‌داری غنی می‌شوند. بر اساس نتایج حاصل، lncRNAهایی که تفاوت بیان معنی‌داری در دو گروه بومی و تجاری دارند با مسیرهای سیستم ایمنی و متیلاسیون مرتبط می‌باشند که می‌توانند به عنوان بیومارکر استفاده شوند.