آنالیز، تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی فیوژن پروتئین OmpL1-LipL41 لپتوسپیرا به عنوان یک کاندید نوین در تولید واکسن لپتوسپیروزیس
نویسندگان
1 گروه میکروبیولوژی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم رازی، سازمان تحقیقات کشاورزی، آموزش و ترویج (AREEO)، کرج، ایران
2 گروه واکسنهای انسانی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم رازی، سازمان تحقیقات کشاورزی، آموزش و ترویج (AREEO)، کرج، ایران
3 گروه میکروبیولوژی، واحد فلاورجان، دانشگاه آزاد اسلامی، اصفهان، ایران
4 گروه میکروبیولوژی، واحد فلاورجان، دانشگاه آزاد اسلامی، اصفهان، ایران
5 گروه ایمونولوژی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم رازی، سازمان تحقیقات کشاورزی، آموزش و ترویج (AREEO)، کرج، ایران
doi
10.22092/vj.2022.358520.1968چکیده
در سال های اخیر با توجه به پیشرفت های انجام شده در حوزه طراحی واکسن، مطالعات بیوانفورماتیک انجام شده بر روی باکتری لپتوسپیرا دستخوش تغییرات و پیشرفتهای قابل توجهی شده است. هدف از این مطالعه طراحی یک پروتئین فیوژن بر مبنای پروتئین های سطحی OmpL1 و LipL41 است که دارای ساختار محافظت شده ای در طی زمان بوده اند. با توجه به مطالعات میدانی قبلی، پروتئین های مورد نظر مورد بررسی قرار گرفته و پروتئین فیوژن OmpL1- LipL41 انتخاب شد. پس از بررسی خصوصیات شیمیایی پروتئین های مورد نظر با استفاده از سرورهای مناسب، ساختار اولیه پروتئین فیوژن تعیین شد و در نهایت این پروتئین درون وکتور PET32a+ و دربین دو ناحیه آنزیمی HindIII وBamHI قرار داده شد. نتایج حاصله نشان داد که وزن پروتئین مورد نظر 73 کیلودالتون بوده و دارای 2097 جفت باز و 610 اسید آمینه می باشد. pH ایزوالکتریک پروتئین فوق 7 و میزان حلالیت آن درسیستم پروکاریوتی 100 درصد است. در نهایت و با توجه به داده های فوق پیش بینی میشود که ساختار کانسترکت طراحی شده، دارای خصوصیات ایمونوژنیکی قابل قبولی میباشد و می توان از آن به میزان قابل قبول و موفقیت آمیزیی درسیستم های پروکاریوتی بیان نمود و جهت مطالعات ایمنیزایی باکتری لپتوسپیرا به عنوان یک کاندید نوین در تولید واکسن لپتوسپیروزیس و در طراحی و ساخت کیت های تشخیصی استفاده نمود.