فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

کاهش چربی محوطه شکمی از اهداف مهم اصلاح نژاد طیور گوشتی است. مسیر گیرنده‌های فعال کننده تکثیر پراکسیزوم (PPARs) نقش مهمی در تجمع چربی ایفا می‌کند. این مسیر شامل گروهی از پروتئین‌های گیرنده هسته‌ای هستند که نقش اساسی در تکثیر، تمایز سلولی و متابولیسم دارند. بنابراین، شناسایی هر چه بهتر ژن‌های دخیل بر این مسیر اهمیت دارد. این تحقیق به منظور پیش‌بینی میکرو RNA های موثر بر مسیر گیرنده‌های فعال‌کننده تکثیر پراکسیزوم با هدف کاهش تجمع چربی در مرغ گوشتی انجام شد. پس از دریافت فایل ژنوم رفرنس مرغ (GRCg6a) از پایگاه داده Ensemble و وارد نمودن آن در پایگاه اطلاعاتی KEGG، تعداد ۶۸ ژن دخیل در مسیر سیگنالینگ PPAR شناسایی شد. سپس شبکه ژنی با استفاده از پایگاه داده استرینگ ترسیم شد. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل شبکه برهمکنش پروتئینی با استفاده از نرم‌افزار سایتواسکیپ انجام گردید. بر اساس شاخص‌های مرکزیت (شامل مرکزیت درجه، بینابینی و نزدیکی) ارائه شده توسط نرم‌فزار سایتواسکیپ ژن‌های ACOX1، PPARA ،LPL،FABP3 ،CPT1A ،EHHADH ، SCD و PPARGC1 به عنوان تاثیرگذار‌ترین ژن‌های مسیر سیگنالینگ PPAR انتخاب گردیدند و با استفاده از پایگاه‌های داده miRBase و Targetscan، میکرو RNA های متناظر با این ژنها شناسایی شدند. در نهایت، پیش بینی ژن هدف و رسم شبکه میانکنش پروتئین- میکروRNA‌ توسط پایگاه داده Mirnet انجام شد. نتایج نشان داد میکرو RNA ی gga-mir-1759-3p بر سه ژن CPT1A، LPL و PPARGC1A تاثیرگذار است. شاید با بکارگیری این میکرو RNA بتوان میزان تجمع چربی را در طیور گوشتی کاهش داد.