تجزیهوتحلیل نواحی ژنی E1A و E1B از آدنوویروس انسانی نوع 8 در بیماران مبتلا به کراتوکونژونکتیویت آدنوویروسی در شهر اهواز
نویسندگان
1 دکتری تخصصی ویروسشناسی، مرکز تحقیقات بیمارهای عفونی و گرمسیری خلیج فارس، پژوهشکده سلامت. دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران
2 دکتری تخصصی ویروسشناسی، مرکز تحقیقات بیمارهای عفونی و گرمسیری خلیج فارس، پژوهشکده سلامت. دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران
3 کارشناس ارشد ویروسشناسی، مرکز تحقیقات بیمارهای عفونی و گرمسیری خلیج فارس، پژوهشکده سلامت. دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران
4 دکتری تخصصی ویروسشناسی، مرکز تحقیقات بیمارهای عفونی و گرمسیری خلیج فارس، پژوهشکده سلامت. دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران
5 متخصص چشمپزشکی، گروه چشمپزشکی، مرکز تحقیقات چشمپزشکی عفونی، دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران
6 دکتری تخصصی آمار، گروه آمار زیستی و اپیدمیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی جندی شاپور اهواز، اهواز، ایران
doi
10.30468/jsums.2024.1602چکیده
زمینه و هدف: کراتوکونژونکتیویت اپیدمیک یک اختلال عفونی حاد چشمی است که اغلب با آدنوویروس انسانی نوع D8 (HAdV-D8) مرتبط میباشد. E1Aو E1B آدنوویروسی بهترتیب از پروتئینهای ضروری برای شروع عفونت آدنوویروسی و اتصال به p53 سلولی میباشند. این مطالعه با هدف تجزیهوتحلیل تنوع ژنومی در ژنهای E1A و HAdV-8 E1Bدر بیماران مبتلا به کراتوکونژونکتیویت آدنوویروسی انجام شده است.مواد و روشها: : نمونه 5 بیمار مبتلا به کراتوکونژونکتیویت آدنوویروسی بر روی رده سلولی A549 به مدت 48 تا 72 ساعت تا ظهور CPE ، کشت داده شد. ناحیه ژنی E1با روش PCR تکثیر شد و برای بررسی های موتاسیون ها توالی یابی شدند.یافتهها: سویه اهواز در ژنهای E1A و E1B بیشترین شباهت را به سویههای ژاپنی و آمریکایی HAdV-D8 و HAdV-D54 دارد. در ژن E1A، جهش مؤثری یافت نشد اما در ژن E1B، جابهجایی اسید آمینه سرین به فنیل آلانین رخ داد. موتاسیون دیگری که باعث تبدیل CTG به GTG در E1B 55KD شد، فقط در دو نمونه مشاهده گردید. تحلیل با ماتریکس BLOSUM62 مؤید آن بود که جابهجایی والین و لوسین محتملتر از جابهجایی سرین و فنیل آلانینِ دارای خاصیت هیدروفوبیکی و وزن مولکولی بالاتر میباشد.نتیجهگیری: در این مطالعه، توالی ژنهای E1A و E1B سویه HAdV-D8 حفاظت بالایی داشتند. بررسی این سویهها و موتاسیونهای در گردش آنها در جامعه بشری میتواند برای تعیین ظرفیت تکاملی ویروس و بیماریزایی آن مفید باشد.
