مقایسه تکنیکال قابلیت‌های دو نرم افزار کاربردی TopHat2 و HISAT2 در تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی داده‌های ترانسکریپتومی مرغ

نویسندگان
رستمی, سپیده ID 1
بیگی نصیری, محمدتقی ID 2
نظری, محمود ID 3
چراغی زاده, محسن ID 4

1 دانشجوی دکترای ژنتیک و اصلاح دام و طیور، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان. دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی. ملاثانی. ایران

2 استاد گروه علوم دامی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان. دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی. ملاثانی. ایران.

3 دانشیار گروه علوم دامی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان. دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی. ملاثانی. ایران.

4 استادیار مرکز تحقیقات مهندسی سطح پیشرفته و نانومواد، گروه مهندسی برق، دانشگاه آزاد واحد اهواز. ایران.

doi
چکیده

در روند تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی داده‌های اومیکس، پس از فرآیند کنترل کیفیت، اولین گام تجزیه و تحلیل اینست که خوانش‌های هر نمونه مبتنی بر ژنوم مرجع همتراز شوند. در این راستا، نرم‌افزارهای متعددی توسط محققان برای این مرحله همترازی پیشنهاد شده است. با این انگیزه تحقیقاتی، هدف از مطالعه حاضر، مقایسه ...

کلیدواژه‌ها
همترازی خوانش, ترانسکریپتوم, HISAT2, TopHat2.