بررسی فعالیت ضد قارچی باکتری های بومی جدا شده از خاک کشاورزی خرم آباد

نویسندگان

1 گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه علوم، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران

2 گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه؛ دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

3 گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه؛ دانشگاه آزاد اسلامی واحد بروجرد، ایران

4 پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، کرج، ایران

5 گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه؛ دانشگاه لرستان، ایران

doi
چکیده

زمینه و هدف: ظهور گونه‌های مقاوم به داروها و همچنین محدودیت استفاده از داروهای ضد قارچی به دلیل اثرات سمی احتمالی در انسان، هزینه بالای تولید آن‌ها و آلودگی محیط‌زیست ناشی از مصرف این داروها تحقیقات موردنیاز برای یافتن ترکیبات ضد قارچی جدید را ضروری دانسته است. میکروارگانیسم‌ها به‌ویژه باکتری‌های خاک طیف گسترده‌ای از مواد ضد میکروبی و فعال را تولید می‌کنند که برخی از آن‌ها خاصیت ضد قارچی دارند. هدف از این مطالعه جداسازی باکتری‌های مؤثر بر رشد قارچ‌ها، از خاک کشاورزی شهرستان خرم‌آباد است.مواد و روش‌ها: نمونه‌برداری از خاک کشاورزی مناطق مختلف شهرستان انجام شد. سپس جداسازی باکتری‌های خاک با استفاده از محیط نوترینت براث و نوترینت آگار انجام و به دنبال آن اثر ضد قارچی مایع رویی و همچنین عصاره آن‌ها به روش انتشار دیسک در محیط SCA بر روی چندین گونه قارچ مورد بررسی قرار گرفت.یافته‌ها: در کل چهار جدایه، دارای اثرات ضد قارچی قابل‌ملاحظه‌ای بر روی برخی قارچ‌ها شامل Aspergillus niger،Aspergillus flavus،Aspergillus fumigatus و Candida albicans بودند. این جدایه‌ها با استفاده از آزمون‌های بیوشیمیایی و تعیین توالی ژن SrRNA16 شناسایی شدند. پس از جستجوی توالی آن‌ها از طریق BLAST در بانک اطلاعاتی NCBI جنس باکتری‌ها متعلق به دو جنس Pseudomonas و Acinetobacter بودند.نتیجه‌گیری: این اولین گزارش از بررسی فعالیت ضد قارچی، باکتری‌های جداشده از خاک کشاورزی خرم‌آباد است. این باکتری‌ها می‌توانند کاندید مناسبی برای کنترل زیستی قارچ‌های بیماری‌زا باشند. استخراج، شناسایی و به‌کارگیری متابولیت‌های مهاری آن‌ها می‌تواند در طراحی و تولید داروهای ضد قارچی استفاده شود.