ارزیابی روش‌های مختلف استخراج DNA ژنومی از نمونه‌های هرباریومی گیاه Myosotis

نویسندگان

1 دانش آموخته زیست¬شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، قم، ایران

2 دانشیار زیست شناسی ، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، قم، ایران

doi
https://doi.org/10.71631/zisti.2024.1204588
چکیده

مقدمه : استخراج DNA بعنوان ابزاری در روشهای مولکولی بسیار دارای اهمیت است. این استخراج از بسیاری گیاهان به دلیل دارا بودن متابولیتهای ثانویه آسان نیست. هدف در این مطالعه، یافتن راهی برای استخراج بهینه DNA از گیاه Myosotis از خانواده گاوزبان می­باشد. مواد و روش­ها : در این مطالعه جهت استخراج DNA از 5 گونه گیاه Myosotis از سه روش CTAB  بدون تغییرات، CTAB با تغییرات و دلاپورتا استفاده شد. نتایج: نتایج نشان داد در روش CTAB بدون تغییرات تنها در گونه M. stricta (جمع آوری2007) باند مشاهده شد. در روش CTAB تغییر یافته گونه­های­ M. stricta (جمع آوری2007)، M. stricta (جمع آوری2012) ، M. asiatica (جمع آوری2004) باندهای قوی و گونه­های M. sparsiflora (جمع آوری1980) و M. sylvatica (جمع­آوری 1988) باند ضعیف­تر ایجاد کرد و در روش دلاپورتا در گونه M. asiatica (جمع آوری2004) باند مشاهده گردید. بحث: در روش CTAB  با تغییرات به دلیل افزایش حجم 60 مرکاپتواتانول (جلوگیری از اکسید شدن پلی فنلها) و استفاده از استات آمونیوم (جدا کردن بهتر هیستونها از اسیدنوکلییک)+ استراحت (فرصت بیشتر برای انجام واکنش­ها)، میزان غلظت DNA بهتری حاصل می­شود. با توجه به احتمال تخریب DNA در نمونه­های قدیمی، DNA استخراجی با کیفیت و کمیت بهتر فقط با روش CTAB با تغییرات حاصل گردید.