شناسایی ژن نوکلئوپروتئین جدایه ویروس بیماریزای نیوکاسل ژنوتیپ XIII.2.1

نویسندگان

1 دانشیارموسسه تحقیقات واکسن و سرم ‌سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد

2 استادیار گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران

3 1. گروه زیست شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران

4 استادیارمؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد

5 رئیس شعبه،موسسه تحقیقات واکسن وسرم سازی رازی شعبه شمال شرق

doi
10.30495/jvm.2022.1948283.1193
چکیده

بیماری نیوکاسل عفونتی فوق العاده مسری در طیور است که توسط ویروس بیماری نیوکاسل ایجاد می شود. این بیماری در سرتاسر دنیا به عنوان یکی از مهمترین بیمار یهای ماکیان به حساب آمده و می تواند گاهی باعث مرگ و میر 100 درصدی در طیور مبتلا گردد. با توجه به تلفات ایجاد شده توسط این ویروس، تشخیص بیماری و نیز اطلاع کافی از سویه های در حال گردش ویروسی امری حیاتی به نظر می رسد. در این پژوهش، مطالعات تکمیلی جهت تعیین هویت مولکولی یک جدایه بیماریزا ویروس بیماری نیوکاسل ژنوتیپ XIII.2.1 به نام RT30/2010 که اولین بار از ایران گزارش شده است، انجام گرفته است. در این مطالعه خالص سازی ویروس طی دو مرحله به روش خالص سازی پلاک انجام شد. سپس توالی کامل ناحیه ی کد شونده ژن NP در این جدایه به منظور فراهم سازی اطلاعات تکمیلی برای شناخت ماهیت و همه گیری مولکولی RT30/2010 مورد تحقیق قرار گرفت. برای این منظور ژن NP این ویروس به کمک پرایمرهای اختصاصی تکثیر و در وکتور PTZ57R/T کلون شد. همچنین جهت شناسایی قسمت انتهایی 3 پرایم ژنوم ویروس که شامل ناحیه ابتدایی ژن NP نیز می شود، از روش (Rapid amplification of cDNA ends) RACE استفاده شد. آﻧﺎﻟﯿﺰ ﻓﯿﻠﻮژﻧﺘﯿﮏ و ﻣﺤﺎﺳﺒﻪ ﻓﻮاﺻﻞ ﺗﮑﺎﻣﻠﯽ ﺗﻮاﻟﯽ ﮐﺪ ﮐﻨﻨﺪه ﮐﺎﻣﻞ ژن نوکلئوپروتئین وﯾﺮوس RT30/2010 ﺑﯿﻤﺎری ﻧﯿﻮﮐﺎﺳﻞ ﮐﻼس II، اﯾﻦ وﯾﺮوس را ﻫﻤﺮاه ﺑﺎ ﺳﻮﯾﻪ ﻫﺎﯾﯽ از ﮐﺸﻮر ﭘﺎﮐﺴﺘﺎن در ﺗﺤﺖ ژﻧﻮﺗﯿﭗ XIII.2.1 ﻗﺮار داد. بنابراین می توان گفت که این ویروس در مقایسه با سایر ویروس های شناسایی شده از ایران دارای خاستگاهی متفاوت است و در دسته ویروس های بیماری نیوکاسل شناسایی شده از پاکستان قرار می گیرد. اطلاعات حاصل از این مطالعه به شناخت بیشتر ویروس کمک کرده و امکان استفاده از این ویروس را به عنوان سویه چلنج و یا استفاده از آن برای ساخت واکسن در برابر ویروس های XIII.2.1 ممکن می سازد.