تنوع ژنتیکی درون گونهای جمعیتهای مختلف نماتد Meloidogyne javanica در مزارع گوجهفرنگی استان خراسان شمالی با استفاده از نشانگر RAPD-PCR
نویسندگان
1
2 گروه گیاهپژشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
3
doi
چکیده
به منظور شناسایی نماتدهای ریشه گرهی گوجهفرنگی در استان خراسان شمالی، طی سالهای 1388 و 1389 تعداد 21 جمعیت از نماتدهای ریشه گرهی از ریشه گوجهفرنگی در مناطق مختلف استان خراسان شمالی جمعآوری و شبکه کوتیکولی انتهای بدن مادههای بالغ و خصوصیات مرفولوژیکی لاروهای سن دو از لحاظ خصوصیات مرفولوژیکی مطالعه و تنوع قابل ملاحظهای بین جمعیتهای مختلف این گونه مشخص نگردید. به منظور مطالعات مولکولی و بررسی تنوع ژنتیکی درون گونهای Meloidogyne javanica، گونه مذکور در گلخانه تکثیر شد. پس از خالصسازی و تکثیر نماتد بر روی رقم حساس گوجهفرنگی (Red colud) در گلخانه، تخمها و لاروهای سن دوم هر ریشه جدا و به عنوان یک جمعیت در نظر گرفته شد. پس از استخراج DNA ژنومی نتایج بررسیهای مرفولوژیکی توسط آغازگرهای اختصاصی گونه M. javanica ارزیابی و برای بررسی میزان تنوع ژنتیکی در جمعیتهای مختلف این گونه از روش RAPD استفاده شد. فرآوردههای حاصل از واکنش PCR بر روی ژل آگارز 7/1 درصد الکتروفورز و چند شکلیهای به وجود آمده از DNA هر جمعیت در این تکنیک، بر اساس وجود یا عدم وجود باند به صورت دادههای صفر و یک ثبت گردید و سپس ماتریس تشابه بر مبنای ضریب شباهت Dice محاسبه شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی بین جمعیتها، ماتریس فاصله ژنتیکی تشکیل و تجزیه خوشهای به روش UPGMA در نرمافزار NTSYS انجام شد. دندروگرام حاصل از دادههای RAPD در سطح تشابه 73٪ به پنج گروه اصلی تقسیم شد. با توجه به نتایج کلی، نشانگر RAPD توانست 73٪ تشابه و 27٪ تفاوت بین جمعیتهای مختلف گونه مورد مطالعه را نشان دهد.