آنالیز فیلوژنیک و مطالعهی خصوصیات توالی ژن LSD142 شش جدایهی ویروس بیماری لمپیاسکین ایران و سویههای ثبت شده کاپریپاکسویروس در بانکژن
نویسندگان
1 گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
2 بخش پاتولوژی و حیوانات تحت آزمایش، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی ، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
3 بخش واکسن های ویروسی دام ، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی ، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
4 بخش واکسن های ویروسی دام ، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی ، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
5 گروه پاتوبیولوژی دانشکده دامپزشکی دانشگاه شیراز، شیراز، ایران
doi
10.22092/vj.2020.343569.1747چکیده
بیماری لمپیاسکین (lumpy skin disease: LSD) یک بیماری ویروسی در گاو است که زیانهای اقتصادی قابل توجهی به صنعت دامپروری وارد میکند. هدف پژوهش کنونی، بررسی خصوصیات توالی ژن LSD142 ، یکی از ژنهای احتمالی موثر بر حدت، در ویروس LSD و آنالیز فیلوژنیک آن در شش جدایهی ایران طی سالهای 1394-1393 و سویههای کاپری-پاکسویروس بانکژن بود. در این پژوهش، ژن LSD142 شش ویروس جدا شده از از استانهای کرمانشاه، آذربایجانغربی، فارس، قم، خوزستان و خراسانشمالی توالییابی شد. سپس با انجام آنالیزفیلوژنیک، قرابت آنها با سایر ویرسهای جنس کاپریپاکس ویروس موجود در بانک ژن مقایسه گردید. نتایج نشاندهنده همولوژی صددرصدی شش جدایه مورد مطالعه با یکدیگر و همچنین با دیگر سویههای حاد عامل LSD در دنیا بود. همچنین، نتایج آنالیز فیلوژنیک نشان داد که با استفاده از اطلاعات توالی این ژن نهتنها میتوان هر سه ویروس آبلهی بزی، آبلهی گوسفندی و ویروس LSD را از یکدیگر تفکیک نمود، بلکه ویروس حاد و واکسینال LSD نیز از یکدیگر قابل تمییز میباشند. خوشه ویروسهای آبلهی بزی به سه دستهی مختلف از نظر جغرافیایی تقسیم شد که سویههای آسیای جنوب غربی و آفریقایی، سویه های شرق آسیا و سویههای شمال غربی آسیا را در بر گرفت. در خوشه ویروسهای آبلهی گوسفندی، تنها ویروس آفریقایی در خوشه مجزایی نسبت به دیگر سویههای آبله گوسفندی قرار گرفت. این یافتهها نشان میدهد که ژن LSD142 میتواند در پایش برنامههای ریشهکنی و پژوهشهای اپیدمیولوژیک کاپریپاکس ویروسها مورد استفاده قرار گیرد.