بررسی فیلوژنی ملکولی عقرب همی اسکورپیوس لپتوروس استان خوزستان براساس توالی DNA ریبوزومی در ناحیه Internal Transcribed Spacers 2 (ITS2)2
نویسندگان
1 دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز
2 گروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز
3 انگل شناسی موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، شعبه اهواز، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی ایران
doi
10.22092/vj.2020.341926.1691چکیده
عقربزدگی یکی از مشکلات جدی برای بهداشت عمومی بویژه در استان خوزستان است. عقربهای جنس Hemiscorpius به عنوان یک عامل مهم در زمینه عقربزدگی و مرگ و میر ناشی از آن بویژه در کودکان مطرح است. یازده نمونه عقرب Hemiscorpius lepturus از 6 منطقه استان خوزستان صید و پس از شناسایی، استخراج ژنومیک DNA به روش دستی فنل/کلروفرم انجام گرفت. به کمک واکنش زنجیرهای پلیمراز، ژن (Internal transcribed spacer 2 (ITS2 با اندازه حدودا 350 نوکلئوتید با استفاده از آغازگرهای رفت و برگشت افزودهسازی و سپس توالی یابی گردید. توالیهای نوکلئوتیدی بهدستآمده با استفاده از برنامه nBLAST موجود در پایگاه اینترنتی NCBI در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج فیلوژنی نشان داد که درخت فیلوژنی ترسیم شده دارای دو خوشه اصلی A و B است، که با میزان همبستگی 85 درصدی از یکدیگر جدا شدند. خوشهی A به سه زیر خوشهی A1 (شامل: H8 ,H9H11M ,H5 ,H44 ,H2 و H10) A2 (شامل: H22 و H4) و A3 (شامل: H10M) قابل تقسیم است، که نمونههای موجود در این زیر خوشهها با هم همبستگی بین 85-54% را نشان دادند. توالیهای مورد مطالعه مشابهت نزدیکی (6/98-7/81%) با تنها توالی عقرب (Hemiscorpius lepturus(KU341981 ثبت شده در پایگاه بانک ژن بهمراه تعدادی از عقربهای خانواده Hemiscorpiidae نشان دادند. تنها نمونه عقرب H9M در خوشه B با فاصله ژنتیکی نسبتا بالایی (1/19-7/11%) متمایز از بقیه نمونهها قرار گرفت، که این یافته احتمالا بیانگر وجود زیر گونهای متفاوت از عقرب Hemiscorpius lepturus استان خوزستان میباشد.