بررسی گروه‌های فیلوژنیک باکتری اشریشیا کلی جدا شده ازمدفوع طیور بر اساس ژن‌های chu, yio, tspe جدا شده از استان کرمان

نویسندگان

1 استادیار، گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ساوه، ساوه، ایران.

2 دانش‌آموخته کارشناسی ‌ارشد، گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد سیرجان، دانشگاه آزاد اسلامی، ایران.

3 استادیار گروه میکروب‌شناسی، واحد تهران شمال، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.

4 استادیار، گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمان، کرمان، ایران.

doi
10.22092/vj.2017.108717.1248
چکیده

اشریشیا کلی یک باکتری گرم منفی روده‌ای و عامل بیماری‌های مهمی در طیور و همچنین در انسان و دارای اهمیت زئونوتیک می‌باشد. این باکتری از لحاظ فیلوژنی به چهار گروه A، B1، B2 و D و زیرگروه‌های بیشتر تقسیم‌بندی می‌شود که این تقسیم‌بندی دارای اهمیت اپیدمیولوژیک می‌باشد. هدف از مطالعه حاضر بررسی شیوع گروه‌های فیلوژنیک اشریشیا کلی در سویه‌های جداسازی شده از مدفوع طیورگوشتی بود. در این مطالعه 60 نمونه اشریشیا کلی جداسازی شده از طیور جمع‌آوری و با آزمون‌های کشت و بیوشیمیایی تایید شدند. آزمون triplex-PCR بر روی جدایه‌ها و با استفاده از ژن‌های chuA، yjaA و قطعه TspE4.C2 جهت تعیین گروه‌های فیلوژنی انجام شد. نتایج مطالعه نشان داد گروه فیلوژنی B2 دارای بیشترین فراوانی در بین سویه‌ها بود و فراوانی زیرگروه‌های A0، A1، B1، B22، B23، D1 و D2 به ترتیب 3/18 درصد، 3/8 درصد، 6/1 درصد، 5 درصد، 6/41 درصد، 3/3 درصد و 6/16 درصد بود. نتایج مطالعه حاضر نشان داد بیشترین سویه‌های اشریشیا کلی جداسازی شده از مدفوع طیور گوشتی متعلق به گروه فیلوژنی B2 بودند که این گروه در انسان نیز از پاتوژن‌های مهم خارج روده‌ای می‌باشد و نشان دهنده اهمیت زئونوتیک جدایه‌های مورد بررسی می‌باشد.