طراحی یک سازه جدید واکسن مولتی اپی توپ پپتیدی علیه SARS-CoV-2 با استفاده از ابزار ایمونوانفورماتیک

نویسندگان

1 گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشکده علوم نوین پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، فارس، ایران

doi
10.22070/daneshmed.2022.15936.1183
چکیده

مقدمه و هدف: ویروس سندرم تنفسی حاد کرونا ویروس (SARS-CoV-2) برای اولین بار در چین ظهور پیدا کرد و به سرعت در سراسر جهان منتشر شد. به دلیل شیوع گسترده آن در سراسر جهان تلاش برای ارائه واکسن موثر و ایمن علیه این ویروس ضروری می باشد. ژنوم این ویروس دارای مولکول RNA تک رشته ای می‌باشد که کدکننده چهار پروتئین ساختاری متفاوت می‌باشد، از میان آنها، پروتئین های اسپایک (S) و نوکلئوکپسید ویروس (N) نقش بسزایی در تحریک سیستم ایمنی در جهت مقابله با ویروس را دارند. واکسن های مولتی اپی توپ پپتیدی که شامل اپی توپ های ایمنی زای سلول های T و B هستند، به دلیل اختصاصیت بالا در سال های اخیر بسیار مورد توجه واقع شده اند. این واکسن ها با استفاده از ابزار ایمونوانفورماتیک طراحی می‌شوند.مواد و روش ها: در این پژوهش پروتئین های S و N  SARS-CoV-2 با کمک سرورهای بیوانفورماتیک به منظور شناسایی اپی توپ‌های سلول های T CD4 و B آنالیز شدند. از زیر واحد B توکسین کلرا و اپی توپ PADRE به عنوان ادجوانت استفاده شد. اجزای مذکور با لینکرهای پپتیدی به هم متصل شدند و ویژگی های سازه واکسن طراحی شده از جمله آنتی ژنیسیته، عدم آلرژنیسیته، خصوصیات فیزیکی و شیمیایی، ساختار دوم و سوم با استفاده از سرورهای بیوانفورماتیک پیشگویی شد.نتایج: براساس نتایج آنالیزهای بیوانفورماتیک سازه مذکور دارای آنتی ژنیسیته بالا بوده و آلرژن نیز نمی‌باشد.نتیجه‌گیری: بنابراین سازه طراحی شده به عنوان یک کاندید واکسن مناسب علیه            SARS-CoV-2 می‌تواند مورد بررسی قرار گیرد، هر چند انجام مطالعات آزمایشگاهی ضروری می‌باشد.